Development· 2026Q1
Mastodon: Büyük Ölçekli Soy Takip Mikroskopi Veri Kümeleri İçin Komuta Merkezi
Mastodon: the command center for large-scale lineage-tracing microscopy datasets
- 4atıf
- Q1SCImago
- 2026yıl
Kısa özet
Mastodon, büyük mikroskopi veri kümelerinden hücre soy hatlarının analizindeki hesaplama zorluklarının üstesinden gelmek için tasarlanmış yeni, ölçeklenebilir bir yazılım platformudur ve manuel, yarı otomatik ve otomatik hücre takibini mümkün kılar.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Mastodon, büyük mikroskopi veri kümelerindeki hücre takibi için bir yazılım platformudur.
- Manuel, yarı otomatik ve otomatik takip yöntemlerini destekler.
- Bir grafik modeli, milyonlarca açıklama ile duyarlı performans sağlar.
- Mastodon, görselleştirme ve 3B analiz için Fiji ve Blender ile entegre olur.
- Platformun, gelişimsel çalışmalarda biyolojik içgörüleri hızlandırdığı gösterilmiştir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Understanding development in living organisms requires following the divisions, movements, and fates of cells. While advances in microscopy have enabled whole-embryo imaging at the cellular level, extracting and analyzing cell lineages from these massive datasets remains a significant computational challenge. We present Mastodon, a scalable, extensible software platform for manual, semi-automated, and automated cell tracking in large images. A purpose-built graph model supports responsive performance for datasets with millions of annotations, making Mastodon a scalable platform for cell lineage analysis. Built as a Fiji plugin, Mastodon enables interactive visualization, editing, and analysis of complex lineage trees, seamlessly integrated with the raw image data. Comprehension of cell lineages in complex three-dimensional geometries is facilitated by interoperability with the powerful open-source render engine Blender. In three distinct developmental contexts, we demonstrate how Mastodon will accelerate biological insights by providing user-friendly navigation and explorative analysis in complex lineage datasets.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Development, 2026 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
BiophysicsBiochemistry, Genetics and Molecular Biology