PofoliaPofolia ile paylaşıldı

Patterns· 2026Q1

SABER: Kriyojenik ET'te Uzman Açıklama Süresini %90 Azaltan Temel Modeller

Large-scale CryoET segmentation from minimal expert annotations with foundation video models

Jonathan Schwartz, Utz Ermel, Saugat Kandel, Hannah Siems ve diğerleri

Kısa özet

Yeni bir çerçeve olan SABER, temel video modellerini ve minimum 2D açıklamaları kullanarak Kriyojenik-elektron tomografi (CryoET) verilerini segmentler, tam denetimli yöntemlerle eşleşirken açıklama süresini %90'a kadar azaltır.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • SABER çerçevesi, CryoET açıklama gereksinimlerini yoğun 3D'den seyrek 2D'ye indirir.
  • Sınırlı uzman açıklamalarından maksimum değeri elde etmek için temel video modellerini kullanır.
  • İki CryoET veri kümesinde tam denetimli temel doğrulukla eşleşir.
  • Açıklama süresini on katına kadar (90%) azaltır.
  • Işık mikroskobu ve hacimsel elektron mikroskobu verileri için geçerlidir.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

Cryo-electron tomography (CryoET) provides molecular-resolution 3D views of intact cells, but quantitative analysis at scale is limited by the time required for dense 3D annotation. Although large and diverse training datasets could eventually enable broadly generalizable segmentation models, such resources do not yet exist for the full diversity of subcellular morphology and context observed in CryoET. We introduce SABER, a segmentation framework designed to maximize the value of scarce expert annotations by replacing the need for dense volumetric supervision with sparse 2D annotations. On two CryoET datasets with ground truth, SABER matches a fully supervised baseline while reducing annotation time by up to an order of magnitude. We further demonstrate its applicability to light microscopy and volumetric electron microscopy data. By substantially lowering the burden of 3D annotation without sacrificing accuracy, SABER enables scalable generation of biologically meaningful segmentations for downstream analysis of large CryoET datasets.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Patterns, 2026 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Structural BiologyBiochemistry, Genetics and Molecular Biology