PofoliaPofolia ile paylaşıldı

Nucleic Acids Research· 2026Q1

ArthroVerse: eklembacaklarla ilişkili mikrobiyomlarda protein ailesi çeşitliliğini haritalama

ArthroVerse: mapping protein family diversity across arthropod-associated microbiomes

Iro N Chasapi, Eleni Aplakidou, Maria N Chasapi, Efthimia Lamari ve diğerleri

Kısa özet

ArthroVerse, eklembacaklarla ilişkili metagenomlardan elde edilen protein ailelerinin ilk kapsamlı veritabanıdır ve mikrobiyal taksonomiyi, konak ilişkilerini ve yapısal bilgileri entegre eder.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • ArthroVerse, eklembacaklarla ilişkili metagenomlardan derlenen yeni bir protein aileleri veritabanıdır.
  • Mikrobiyal taksonomiyi, konak ilişkilerini ve protein yapısal bilgilerini entegre eder.
  • Veritabanı, karbonhidrat aktif enzimler için tahminleri içerir.
  • Metagenomik ve referans genom kaynaklarından gelen verileri birleştirir.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

Metagenomic studies of arthropod-associated microbiomes have generated vast amounts of sequence data, yet the functional and structural organization of these proteins remains largely unexplored. Here, we present ArthroVerse, the first comprehensive database of protein families derived from arthropod-associated metagenomes. Non-redundant protein families were generated after rigorous filtering, deduplication, and clustering. The protein families were further annotated with microbial taxonomy, host associations, protein structural information, and carbohydrate-active enzymes predictions. The resulting dataset integrates both metagenomic and reference genome-derived proteins, enabling systematic exploration of functional diversity, evolutionary relationships, and host-microbe interactions in insect microbiomes. ArthroVerse provides a valuable resource for the study of microbial ecology and arthropod physiology, offering unprecedented insight into the protein landscape of insect-associated microbial communities. ArthroVerse is publicly accessible at https://envofams.org/arthroverse/.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nucleic Acids Research, 2026 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Alan: Böcek Bilimi (Entomoloji)

Insect ScienceAgricultural and Biological Sciences