International Journal of Molecular Sciences· 2026Q1
Kronik Stres Danio rerio Telensefalonunda Glukokortikoid Reseptör Transkripsiyonel Programını Zayıflatır
Chronic Stress Attenuates the Glucocorticoid Receptor Transcriptional Programme in the Danio rerio Telencephalon
- 0atıf
- Q1SCImago
- 2026yıl
Kısa özet
Zebra balığı telensefalonundan elde edilen RNA-seq verilerinin yeniden analizi, kronik öngörülemeyen stresin glukokortikoid reseptörüne bağlı transkripsiyonda koordineli, ayna simetrik bir kaymaya neden olduğunu ortaya koydu; reseptör kaynaklı genler aşağı regüle edilirken, reseptör baskılanmış genler yukarı regüle edildi (p ≈ 0.001).
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Kronik öngörülemeyen stres sonrası zebra balığı telensefalonundan elde edilen RNA-seq verilerinin yeniden analizi, 275 farklı şekilde ifade edilen gen belirledi.
- Kronik stres, glukokortikoid reseptörüne bağlı transkripsiyonda ayna simetrik bir kaymaya neden oldu.
- Reseptör kaynaklı gen setleri aşağı regüle edildi ve reseptör baskılanmış gen setleri yukarı regüle edildi (her ikisi için de p ≈ 0.001).
- Epidermal içerik ve genomik kümelenme ile ilgili gen düzeyinde artefaktlar belirlendi ve ele alındı.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
We reanalysed public RNA-seq data from the telencephalon of adult zebrafish after 14 days of chronic unpredictable stress. The deposited runs concatenate pooled libraries, hiding the replicates; we recovered the library boundaries from the block structure of unaligned reads and realigned to GRCz11 with splicing enabled. Unique alignment rose from 63.7–64.2% to 80.6–81.6%, and 275 genes were differentially expressed (FDR < 0.05), 101 of the 155 reported previously and 174 new, with effect sizes matching the published ones (ρ = 0.754). Against gene sets from an nr3c1 knockout, the data show a coordinated, mirror-symmetric shift in receptor-dependent transcription—the receptor-induced set down, the receptor-repressed set up (p ≈ 0.001 for both)—while the original study reported cortisol at control level; “receptor-dependent” denotes set membership, not receptor occupancy. Two artefacts constrain the reading of individual genes: epidermal content differs between groups while neuronal content does not, and the gene list is clustered in the genome far beyond chance. Removing the 85 flagged genes (of 275) leaves the receptor-level result intact (p = 0.0008 and 0.0014) but withdraws the conclusions on keratins and barrier structures. That removal addresses gene-level artefact, not sample composition, which six libraries cannot settle: a between-group difference in tissue composition remains an alternative explanation.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. International Journal of Molecular Sciences, 2026 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Davranışsal Sinirbilim
Behavioral NeuroscienceNeuroscience