Communications Biology· 2026Q1
Transkriptomik belirteçler, Arabidopsis thaliana'da saha otçulluğu altındaki jasmonik ve salisilik asit durumlarını ortaya koyuyor
Transcriptomic biomarkers reveal jasmonic and salicylic acid states under field herbivory in Arabidopsis thaliana
- 0atıf
- Q1SCImago
- 2026yıl
Kısa özet
Transkriptomik verilerden türetilen makine öğrenimi belirteçleri, Arabidopsis thaliana'da salisilik asit (SA) ve jasmonik asit (JA) yanıt durumlarını bağımsız olarak ölçebilir ve saha koşullarındaki otçulluk tarafından şekillendirilen dinamik hormonal yanıtları ortaya çıkarır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- SA ve JA'nın belirli konsantrasyon kombinasyonlarına karşılık gelen 43 farklı transkriptomik imza belirlendi.
- Transkriptomlardan SA ve JA yanıt durumlarını bağımsız olarak ölçebilen makine öğrenimi belirteçleri geliştirildi.
- Saha otçulluğunun, otçul varlığına ve birlikte bulunmasına bağlı olarak SA/JA yanıt durumlarını dinamik olarak şekillendirdiği gösterildi.
- Saha transkriptomlarından biyotik ortamlara verilen hormonal yanıtları çözmek için bir strateji sunmaktadır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Abstract Plants coordinate defence against pathogens and herbivores through the crosstalk between salicylic acid (SA) and jasmonic acid (JA) signalling pathways. However, little is known about how plants integrate the phytohormone concentration profiles to shape defence states in complex field environments. Here we show that systematically varying combinatorial SA and JA concentrations in Arabidopsis thaliana reveals 43 distinct combination-specific transcriptional signatures beyond SA–JA antagonism. Leveraging these data, we developed and validated machine-learning-based transcriptomic biomarkers that enabled independent quantification of SA and JA response states. By applying these biomarkers to field-grown A. thaliana , we revealed that SA/JA response states were dynamically shaped by abundant and co-occurrence of herbivores on individual plants. Our study provides a strategy to decode hormonal responses to biotic environments from field transcriptomes, bridging the gap between molecular signalling and ecological dynamics.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Communications Biology, 2026 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Böcek Bilimi (Entomoloji)
Insect ScienceAgricultural and Biological Sciences