PofoliaPofolia ile paylaşıldı

eLife· 2026Q1

In extracto cryo-EM, eEF2'yi 60S ve 80S parçacıklarında önemli bir hibernasyon faktörü olarak ortaya koyuyor

In extracto cryo-EM reveals eEF2 as a major hibernation factor on 60S and 80S particles

Zahra Seraj, Ximena Zottig, Chun‐Ying Huang, A.B. Loveland ve diğerleri

Kısa özet

In extracto cryo-EM, memeli ribozomlarının yaklaşık 2.2 Å çözünürlüğünde haritalar elde ederek, elongasyon faktörü 2'nin (eEF2) %95'ten fazla hibernasyon halindeki ribozomlarda ve beklenmedik bir şekilde 60S alt birimlerinde bağlı olduğunu ortaya koydu.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • Hücre lizatları içindeki hücresel bileşenlerin yaklaşık 2.2 Å çözünürlüğünde analizini sağlamak için 'in extracto cryo-EM' geliştirildi.
  • Hibernasyon halindeki ribozomların (mRNA'sız) çok sayıda protein tarafından korunduğu bulundu.
  • eEF2'nin, hibernasyon halindeki ribozomların %95'inden fazlasına ve 60S alt birimlerine bağlı en bol hibernasyon faktörü olduğu belirlendi.
  • eEF2•GDP, sarkin-risin döngüsü ve uL14 proteini ile etkileşimlerle stabilize edilir.
  • Hibernasyon halindeki ribozomlarda LARP1 ve eIF5A gibi diğer hibernasyon faktörleri de gözlemlendi.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

Abstract Cryogenic electron microscopy (cryo-EM) made impressive progress in resolving cellular macromolecules and their detailed interactions. Single-particle cryo-EM traditionally relies on purified macromolecules and lacks the complexity of cellular environments, whereas in situ cryo-EM or cryo-ET require extensive sample preparation and data acquisition, presenting challenges in achieving high resolution. We describe cryo-EM of cellular lysates— in extracto cryo-EM—allowing the flexibility and high-resolution of cryo-EM in the context of cellular components. High-resolution 2D template matching (2DTM) yields ∼2.2 Å maps of the mammalian translational apparatus. Elongating ribosome abundances in primate cell lines (MCF-7 and BSC-1) and rabbit reticulocyte lysates range from ∼70% to ∼10%, reflecting translational stress responses. Non-translating (hibernating) ribosomes carrying no mRNA, feature numerous proteins shielding ribosomal functional centers. Elongation factor 2 (eEF2) is the most abundant hibernation factor bound to >95% of ribosomes and, unexpectedly, to 60S subunits. eEF2•GDP is stabilized by interactions with the sarcin-ricin loop and protein uL14. Hibernating ribosomes also feature LARP1 involved in initiation and mTOR signaling; eIF5A implicated in elongation and termination; and other factors, exposing the variety of hibernation scenarios. Our work underscores the efficiency and potential of in extracto cryo-EM to discover native cellular complexes and mechanisms at near-atomic resolution.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. eLife, 2026 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Structural BiologyBiochemistry, Genetics and Molecular Biology