Physical Chemistry Chemical Physics· 2021Q2
Bilgisayarlı optimize edilmiş kod ile elektrostatik potansiyelin verimli değerlendirilmesi
Efficient evaluation of electrostatic potential with computerized optimized code
- 2.451atıf
- Q2SCImago
- 2021yıl
Kısa özet
Moleküler elektrostatik potansiyel (ESP) hesaplamalarını önemli ölçüde hızlandıran yeni bir algoritma, hesaplamalı kimya simülasyonlarında kritik bir adımı kolaylaştırıyor.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Moleküler elektrostatik potansiyel (ESP) hesaplaması için verimli bir algoritma geliştirildi.
- Algoritma, optimizasyon için Gauss tipi orbital ifadelerini yeniden gruplandırır.
- Sıradan donanımda MOF-5 için 1874 saniye gibi hızlı hesaplama süreleri elde edildi.
- Popüler son teknoloji kodlara kıyasla benzer veya daha iyi performans gösterildi.
- Kod iyi paralelleştirme ölçeklenmesi sergiler ve ücretsiz olarak mevcuttur.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
The evaluation of molecular electrostatic potential (ESP) is a performance bottleneck for many computational chemical tasks like restrained ESP charge fitting or quantum mechanics/molecular mechanics simulations. In this paper, an efficient algorithm for the evaluation of ESP is proposed. It regroups the expression in terms of primitive Gaussian type orbitals (GTOs) with identical angular momentum types and nuclei centers. Each term is calculated using a computerized optimized code. This algorithm was integrated into the wavefunction analysis program Multiwfn and was tested on several large systems. In the cases of dopamine and remdesivir, the performance of this algorithm was comparable to or better than some popular state-of-the-art codes. For meta1-organic framework-5, where the number of GTOs and ESP points is 4840 and 259 262, respectively, our code could finish the evaluation in 1874 seconds on ordinary hardware. It also exhibits good parallelization scaling. The source code of this algorithm is freely available and can become a useful tool for computational chemists.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Physical Chemistry Chemical Physics, 2021 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Elektrokimya
ElectrochemistryChemistry