Journal of Chemical Information and Modeling· 2023Q1
NVIDIA ve AMD Grafik İşlem Birimlerinde Kuantum Mekaniği/Moleküler Mekaniği Simülasyonları
Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Simulations on NVIDIA and AMD Graphics Processing Units
- 51atıf
- Q1SCImago
- 2023yıl
Kısa özet
Kuantum mekaniği/moleküler mekaniği (QM/MM) simülasyonları, QUICK/AMBER yazılımı kullanılarak hem bağımsız HF/DFT hem de QM/MM moleküler dinamik simülasyonlarında NVIDIA V100 ve AMD MI100 GPU'larda benzer performans sergiliyor.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- QM/MM simülasyonları artık QUICK'te Fock matris yapımı ve kuvvet hesaplamaları dahil olmak üzere AMD GPU'larda verimli bir şekilde çalışmaktadır.
- NVIDIA V100 ve AMD MI100 GPU'lar, QUICK/AMBER QM/MM moleküler dinamikleri için benzer performans göstermektedir.
- QUICK/AMBER sürüm 21'e kıyasla önemli hızlanmalar elde edilmiştir.
- Açık kaynaklı QM/MM yazılımının gelişmiş donanımlarda kullanılarak karmaşık bilimsel problemlere erişilebilirliğini artırmaktadır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) implementation on AMD GPUs. This encompasses the entire Fock matrix build and force calculation in QUICK including one-electron integrals, two-electron repulsion integrals, exchange-correlation quadrature, and linear algebra operations. General performance improvements to the QUICK GPU code are also presented. Benchmarks carried out on NVIDIA V100 and AMD MI100 cards display similar performance on both hardware for standalone HF/DFT calculations with QUICK and QM/MM molecular dynamics simulations with QUICK/AMBER. Furthermore, with respect to the QUICK/AMBER release version 21, significant speedups are observed for QM/MM molecular dynamics simulations. This significantly increases the range of scientific problems that can be addressed with open-source QM/MM software on state-of-the-art computer hardware.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Journal of Chemical Information and Modeling, 2023 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Bilgisayar Ağları ve İletişim
Computer Networks and CommunicationsComputer Science