Nature Genetics· 2025Q1
Yaşayan insan hücrelerinde kohezin aracılı döngü ekstrüzyonunun tekdüze dinamikleri
Uniform dynamics of cohesin-mediated loop extrusion in living human cells
- 15atıf
- Q1SCImago
- 2025yıl
Kısa özet
TAD çapaları, sürekli ekstrüzyon yapan kohezin kompleksleri tarafından yönlendirilerek, saatte yaklaşık bir kez 6-19 dakika boyunca birbirine yaklaştırılır; bu da TAD dinamiklerinin CTCF bölgesi konumu ve afinitesi tarafından yönetildiğini düşündürmektedir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- TAD çapaları, yaşayan insan hücrelerinde yaklaşık olarak saatte bir kez 6-19 dakika boyunca birbirine yaklaştırılır.
- TAD'ler, birden fazla kohezin kompleksi tarafından sürekli olarak ekstrüde edilir.
- Kohezin dinamikleri, Hi-C desenlerindeki farklılıklara bakılmaksızın çeşitli kromatin bölgelerinde tutarlıdır.
- TAD dinamikleri öncelikli olarak CTCF bölgelerinin konumu ve afinitesi tarafından yönetilir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Most animal genomes are partitioned into topologically associating domains (TADs), created by cohesin-mediated loop extrusion and defined by convergently oriented CCCTC-binding factor (CTCF) sites. The dynamics of loop extrusion and its regulation remain poorly characterized in vivo. Here we tracked the motion of TAD anchors in living human cells to visualize and quantify cohesin-dependent loop extrusion across multiple endogenous genomic regions. We show that TADs are dynamic structures whose anchors are brought in proximity about once per hour and for 6-19 min (~16% of the time). Moreover, TADs are continuously extruded by multiple cohesin complexes. Remarkably, despite strong differences in Hi-C patterns across chromatin regions, their dynamics is consistent with the same density, residence time and speed of cohesin. Our results suggest that TAD dynamics is primarily governed by the location and affinity of CTCF sites, enabling genome-wide predictive models of cohesin-dependent chromatin interactions.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nature Genetics, 2025 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Moleküler Biyoloji
Molecular BiologyBiochemistry, Genetics and Molecular Biology