Journal of Peptide Science· 2026Q2
Hidrojen Bağları Proteinlerde İzole Amino Asit Kalıntılarının Konformasyonunu Belirliyor: Tamamen Genişletilmiş C5 Yapılarının Yeniden İncelenmesi
Hydrogen Bonds Determining the Conformation of Isolated Amino Acid Residues in Proteins: Re‐Examination of the Fully Extended C5 Structures
- 0atıf
- Q2SCImago
- 2026yıl
Kısa özet
Intrarezidü C5 hidrojen bağları, proteinlerde tamamen genişlemiş amino asit konformasyonlarını (φ, ψ ≈ ±180°) stabilize eder; Glisin en yüksek eğilimi gösterirken, Lösin, Valin ve İlösin gibi dallı zincirli kalıntılar dezavantajlıdır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Intrarezidü C5 hidrojen bağları, tamamen genişlemiş amino asit konformasyonlarını (φ, ψ ≈ ±180°) stabilize eder.
- Glisin, C5 konformasyonları için en yüksek eğilime sahiptir, ardından Serin gelir.
- Dallı yan zincirli kalıntılar (Lösin, Valin, İlösin) C5 konformasyonlarını benimseme konusunda güçlü bir dezavantaja sahiptir.
- Analiz, yüksek çözünürlüklü (≤1.6 Å çözünürlük, <%30 dizi kimliği) 6924 adet homolğu olmayan x-ışını kırınım yapısı veri seti kullanılarak yapılmıştır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Hydrogen bonds contribute substantially to the stabilisation of specific three-dimensional structures of peptides. The C5 hydrogen bond is an intraresidue interaction, which appears to contribute to the stabilisation of fully extended residue conformations, with backbone torsion angles (φ, ψ) lying close to ±180°. The present study revisits the occurrence of C5 conformations in proteins, using a high-resolution, non-homologous dataset of 6924 x-ray diffraction structures (sequence identity < 30%, resolution < 1.6 Å). Gly emerges as the residue with the highest propensity to adopt C5 conformations, followed by Ser. Residues with branched sidechains Leu, Val and Ile are strongly disfavoured. Specific examples in protein structures that have contiguous residues in C5 conformations are highlighted.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Journal of Peptide Science, 2026 · DOI ↗
Devamı Pofolia uygulamasında
Çıkarımlar ve makaleye soru sorma; ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Ücretsiz.
Web'de giriş yaparak açAlan: Fiziksel ve Teorik Kimya
Physical and Theoretical ChemistryChemistry