Emerging Microbes & Infections· 2020Q1
2019 Yeni İnsan Patojen Koronavirüsünün Genomik Karakterizasyonu
Genomic characterization of the 2019 novel human-pathogenic coronavirus isolated from a patient with atypical pneumonia after visiting Wuhan
- 3.282atıf
- Q1SCImago
- 2020yıl
Kısa özet
2019 yeni koronavirüs (2019-nCoV) genomu, yarasa SARS-benzeri-CoVZXC21 ile %89 nükleotid benzerliği ve insan SARS-CoV ile %82 benzerlik gösterirken, Spike reseptör bağlayıcı alanında sadece %40 amino asit benzerliği vardır ve orf3b'de tamamen yeni bir kısa protein kodlar.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- 2019-nCoV genomu, yarasa SARS-benzeri-CoVZXC21 ile %89, insan SARS-CoV ile %82 nükleotid benzerliğine sahiptir.
- Spike reseptör bağlayıcı alanının dış alt birimi, diğer SARS ile ilişkili koronavirüslerle sadece %40 amino asit benzerliği paylaşır.
- orf3b, tamamen yeni bir kısa protein kodlar.
- Yeni orf8, muhtemelen alfa-heliks içeren ve ardından beta-tabaka(lar) içeren altı iplikçik içeren salgılanan bir protein kodlar.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
A mysterious outbreak of atypical pneumonia in late 2019 was traced to a seafood wholesale market in Wuhan of China. Within a few weeks, a novel coronavirus tentatively named as 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) was announced by the World Health Organization. We performed bioinformatics analysis on a virus genome from a patient with 2019-nCoV infection and compared it with other related coronavirus genomes. Overall, the genome of 2019-nCoV has 89% nucleotide identity with bat SARS-like-CoVZXC21 and 82% with that of human SARS-CoV. The phylogenetic trees of their orf1a/b, Spike, Envelope, Membrane and Nucleoprotein also clustered closely with those of the bat, civet and human SARS coronaviruses. However, the external subdomain of Spike’s receptor binding domain of 2019-nCoV shares only 40% amino acid identity with other SARS-related coronaviruses. Remarkably, its orf3b encodes a completely novel short protein. Furthermore, its new orf8 likely encodes a secreted protein with an alpha-helix, following with a beta-sheet(s) containing six strands. Learning from the roles of civet in SARS and camel in MERS, hunting for the animal source of 2019-nCoV and its more ancestral virus would be important for understanding the origin and evolution of this novel lineage B betacoronavirus. These findings provide the basis for starting further studies on the pathogenesis, and optimizing the design of diagnostic, antiviral and vaccination strategies for this emerging infection.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Emerging Microbes & Infections, 2020 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Enfeksiyon Hastalıkları
Infectious DiseasesMedicine