iScience· 2026Q1
Antimikrobiyal duyarlılık testinde gizli ortak test etme örüntülerinin ağ tabanlı karakterizasyonu
Network-based characterization of latent co-testing patterns in antimicrobial susceptibility testing
- 0atıf
- Q1SCImago
- 2026yıl
Kısa özet
Bu çalışma, antibiyotik ortak test etme örüntülerinin gizli yapıları olan 'gölge antibiyogramlarını' tanıtmaktadır; Almanya'daki antibiyotik ortak test etme ağlarının (yaklaşık 13 milyon izolat) tutarlı bir şekilde 3-4 baskın topluluk oluşturduğunu ve Jaccard benzerliğinin analiz için en etkili yöntem olduğunu ortaya koymaktadır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Antimikrobiyal duyarlılık testindeki antibiyotik ortak test etme örüntülerinin ampirik yapılarını tanımlamak için 'gölge antibiyogramları' tanıtıldı.
- Ortak test etme ağlarını oluşturmak için Almanya'dan yaklaşık 13 milyon bakteriyel izolat (2019-2023) analiz edildi.
- Farklı kohortlar ve örnek türlerinde tutarlı bir şekilde 3-4 baskın ortak test etme topluluğu belirlendi.
- Jaccard benzerliği, birden fazla değerlendirme kriterini dengeleyerek ağ analizi için en etkili metrik olarak bulundu.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Antimicrobial resistance (AMR) surveillance depends on antimicrobial susceptibility testing, yet antibiotic panels vary by pathogen cohort, specimen, year, ward, and care setting. We term these empirically reconstructed testing architectures shadow antibiograms: structures that shape which susceptibility results enter surveillance datasets and which resistance relationships can be observed. We analyzed approximately 13 million bacterial isolates from Germany's National Antibiotic Resistance Surveillance system (2019–2023) across six WHO BPPL-aligned operational cohorts. Co-testing networks were constructed using Jaccard, Dice, cosine, and phi-coefficient similarity, evaluated with Fisher's exact tests and Benjamini-Hochberg correction, and partitioned with multi-resolution Louvain community detection. Networks contained three to four dominant co-testing communities; false discovery rate (FDR) retention ranged from 89 to 100% across cohorts and specimen types. Jaccard provided the best balance of coherence, stability, antimicrobial-class alignment, interpretability, and edge retention. This work provides one of the first national-scale empirical characterizations of shadow antibiogram structure, supporting diagnostic stewardship and bias-aware AMR surveillance interpretation.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. iScience, 2026 · DOI ↗
Devamı Pofolia uygulamasında
Çıkarımlar ve makaleye soru sorma; ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Ücretsiz.
Web'de giriş yaparak açAlan: Klinik Biyokimya
Clinical BiochemistryBiochemistry, Genetics and Molecular Biology