Clinical Cancer Research· 2014Q1
HPV-Pozitif ve HPV-Negatif Baş ve Boyun Skuamöz Hücreli Karsinomlarının Bütünleşik ve Karşılaştırmalı Genomik Analizi
Integrative and Comparative Genomic Analysis of HPV-Positive and HPV-Negative Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
- 662atıf
- Q1SCImago
- 2014yıl
Kısa özet
HPV-pozitif ve HPV-negatif baş ve boyun skuamöz hücreli karsinomları (HNSCC), FGFR ve PI3K yolaklarındaki hedeflenebilir mutasyonlar da dahil olmak üzere belirgin genetik farklılıklar göstermektedir; HPV-pozitif tümörlerde FGFR3 S249C mutasyonları (%17,6) ve KRAS mutasyonları (%5,8) benzersiz şekilde zengindir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- HPV-pozitif ve -negatif HNSCC'ler benzer genel mutasyon yüküne ancak farklı mutasyon profillerine sahiptir.
- HPV-negatif HNSCC, TP53, CDKN2A, MLL2, CUL3, NSD1, PIK3CA ve NOTCH genlerindeki mutasyonlarda zenginleşme göstermektedir.
- HPV-pozitif HNSCC, DDX3X ve FGFR2/3'te benzersiz mutasyonlar sergilemekte olup, %17,6'sı tekrarlayan FGFR3 S249C mutasyonlarına sahiptir.
- FGFR1, DDR2, EGFR, FGFR2/3, EPHA2 ve PIK3CA dahil olmak üzere hedeflenebilir genetik değişiklikler her iki alt tipte de tanımlanmıştır.
- HPV-pozitif HNSCC, %5,8 KRAS mutasyon insidansı ve %7,8 BRCA1/2 mutasyon insidansı göstermektedir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
PURPOSE: The genetic differences between human papilloma virus (HPV)-positive and -negative head and neck squamous cell carcinomas (HNSCC) remain largely unknown. To identify differential biology and novel therapeutic targets for both entities, we determined mutations and copy-number aberrations in a large cohort of locoregionally advanced HNSCC. EXPERIMENTAL DESIGN: We performed massively parallel sequencing of 617 cancer-associated genes in 120 matched tumor/normal samples (42.5% HPV-positive). Mutations and copy-number aberrations were determined and results validated with a secondary method. RESULTS: The overall mutational burden in HPV-negative and HPV-positive HNSCC was similar with an average of 15.2 versus 14.4 somatic exonic mutations in the targeted cancer-associated genes. HPV-negative tumors showed a mutational spectrum concordant with published lung squamous cell carcinoma analyses with enrichment for mutations in TP53, CDKN2A, MLL2, CUL3, NSD1, PIK3CA, and NOTCH genes. HPV-positive tumors showed unique mutations in DDX3X, FGFR2/3 and aberrations in PIK3CA, KRAS, MLL2/3, and NOTCH1 were enriched in HPV-positive tumors. Currently targetable genomic alterations were identified in FGFR1, DDR2, EGFR, FGFR2/3, EPHA2, and PIK3CA. EGFR, CCND1, and FGFR1 amplifications occurred in HPV-negative tumors, whereas 17.6% of HPV-positive tumors harbored mutations in fibroblast growth factor receptor genes (FGFR2/3), including six recurrent FGFR3 S249C mutations. HPV-positive tumors showed a 5.8% incidence of KRAS mutations, and DNA-repair gene aberrations, including 7.8% BRCA1/2 mutations, were identified. CONCLUSIONS: The mutational makeup of HPV-positive and HPV-negative HNSCC differs significantly, including targetable genes. HNSCC harbors multiple therapeutically important genetic aberrations, including frequent aberrations in the FGFR and PI3K pathway genes. See related commentary by Krigsfeld and Chung, p. 495.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Clinical Cancer Research, 2014 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Kulak Burun Boğaz
OtorhinolaryngologyMedicine