Nature Communications· 2013Q1
Tümör modelleri olarak hücre hatlarının genomik profillerinin karşılaştırılması yoluyla değerlendirilmesi
Evaluating cell lines as tumour models by comparison of genomic profiles
- 1.497atıf
- Q1SCImago
- 2013yıl
Kısa özet
Araştırmacılar, yaygın olarak kullanılan hatlardan daha fazla gerçek tümör genomik profillerine benzeyen over kanseri hücre hatlarını belirleyerek, bunları kanser araştırmaları için daha üstün modeller olarak önermişlerdir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Yaygın olarak kullanılan over kanseri hücre hatları, gerçek tümör örneklerine kıyasla belirgin moleküler farklılıklar göstermektedir.
- Daha az kullanılan birkaç hücre hattı, over tümörlerine daha yüksek genetik benzerlik sergilemektedir.
- Kopya sayısı değişiklikleri, mutasyonlar ve mRNA ekspresyon profillerinin genomik karşılaştırması kullanılmıştır.
- Bulgular, kanser araştırmaları için daha doğru hücre hattı modelleri seçme yöntemini önermektedir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Cancer cell lines are frequently used as in vitro tumour models. Recent molecular profiles of hundreds of cell lines from The Cancer Cell Line Encyclopedia and thousands of tumour samples from the Cancer Genome Atlas now allow a systematic genomic comparison of cell lines and tumours. Here we analyse a panel of 47 ovarian cancer cell lines and identify those that have the highest genetic similarity to ovarian tumours. Our comparison of copy-number changes, mutations and mRNA expression profiles reveals pronounced differences in molecular profiles between commonly used ovarian cancer cell lines and high-grade serous ovarian cancer tumour samples. We identify several rarely used cell lines that more closely resemble cognate tumour profiles than commonly used cell lines, and we propose these lines as the most suitable models of ovarian cancer. Our results indicate that the gap between cell lines and tumours can be bridged by genomically informed choices of cell line models for all tumour types.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nature Communications, 2013 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Üreme Tıbbı
Reproductive MedicineMedicine