Network Modeling Analysis in Health Informatics and Bioinformatics· 2026Q2
Çapraz veri kümesi transkriptomik analizi, Parkinson hastalığında beslenme genetiği müdahaleleriyle modüle edilen oksidatif Stres–inflamasyon gen ağlarını tanımlar
Cross-dataset transcriptomic analysis identifies oxidative Stress–inflammation gene networks modulated by nutrigenomic interventions in Parkinson’s disease
- 0atıf
- Q2SCImago
- 2026yıl
Kısa özet
Çapraz veri kümesi transkriptomik analizi, Parkinson hastalığında (PH) tutarlı bir şekilde düzensizleşen 26 oksidatif stres-inflamasyonla ilişkili gen ve 10 merkezi düzenleyiciyi (TH, SNCA, LRRK2 dahil) tanımladı; bu genler bağımsız bir veri kümesinde doğrulandı.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Parkinson hastalığında (PH) dört veri kümesi boyunca 183 farklı şekilde ifade edilen gen (DEG) tanımlandı.
- Bağımsız bir substantia nigra RNA dizileme veri kümesinde, tutarlı ifade yönüyle 35 DEG doğrulandı.
- TH, SNCA ve LRRK2 dahil olmak üzere PH'de 26 oksidatif stres-inflamasyonla ilişkili gen ve 10 merkezi düzenleyici belirlendi.
- Beslenme genetiği entegrasyonu, gıda biyoaktif bileşiklerinin daha düşük stres geni ifadesi ve daha yüksek dopaminerjik belirteç ifadesi (örn. TH, DDC) ile ilişkili olduğunu gösterdi.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Abstract Inflammation and oxidative stress (OS) are key to Parkinson’s disease (PD). We performed a cross-dataset integrative transcriptomic analysis to identify OS- and inflammation-related hub genes consistently dysregulated in PD and to explore gene–compound relationships using nutrigenomic studies using publicly available datasets. Four GEO datasets (GSE7621, GSE20141, GSE20146, GSE49036) were analysed to identify differentially expressed genes (DEGs), which were intersected with GeneCards OS–inflammation gene sets. Functional enrichment analyses, including gene ontology (GO), pathway over-representation analysis (ORA), and protein-protein interaction (PPI) analysis, were used to identify key pathways and hub genes. Gene–food bioactive compound (FBC) association was explored by integrating PD signatures with nutrigenomic profiles from NutriGenomeDB. We identified 183 DEGs in PD, enriched in synaptic, dopaminergic, OS, and inflammatory pathways. Independent validation in a substantia nigra RNA-sequencing dataset (GSE168496) replicated 35 DEGs, all with concordant direction of expression and FDR < 0.05. Intersection analysis yielded 26 OS-inflammation-related genes and 10 central regulators, including TH , DDC , SNCA , LRRK2 , HSPB1 , and HSPA1B . Integration with nutrigenomic datasets revealed opposing-direction transcriptional patterns, with several FBC-associated signatures showing lower expression of stress-related genes and higher expression of dopaminergic markers such as TH , GCH1 , and DDC. Overall, this integrative analysis highlights validated OS–inflammation-associated transcriptional patterns in PD and identifies candidate diet–gene associations that warrant further experimental and clinical validation.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Network Modeling Analysis in Health Informatics and Bioinformatics, 2026 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Nöroloji (Tıp)
NeurologyMedicine