PofoliaPofolia ile paylaşıldı

The Journal of Chemical Physics· 2013Q1

Çift doğal orbital içeren lokal bağlı küme hesaplamalarında doğal üçlü uyarılmalar

Natural triple excitations in local coupled cluster calculations with pair natural orbitals

Christoph Riplinger, Barbara Sandhoefer, Andreas Hansen, Frank Neese

Kısa özet

DLPNO-CCSD(T) adlı yeni bir yöntem, üçlü uyarılmaları bağlı küme hesaplamalarına yakın doğrusal ölçekli hesaplama maliyetiyle doğru bir şekilde dahil ederek proteinler gibi büyük moleküller üzerinde CCSD(T) hesaplamalarına olanak tanır.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • DLPNO-CCSD(T) yöntemi, üçlü uyarılmaları lokal bağlı küme hesaplamalarına entegre eder.
  • Yöntem, ilgili elektron çifti uzaylarını kapsamak için üçlü-doğal orbitaller kullanır.
  • Hesaplama maliyeti, alkan zincirlerinde doğrulanmış sistem boyutuna göre neredeyse doğrusal olarak ölçeklenir (O(N)).
  • Göreceli enerjiler, organik moleküller için ortalama 0.5 kcal/mol hata ile tahmin edilir.
  • Yöntem, 644 atomlu Crambin proteininin ilk CCSD(T) hesaplamasını mümkün kılmıştır.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

In this work, the extension of the previously developed domain based local pair-natural orbital (DLPNO) based singles- and doubles coupled cluster (DLPNO-CCSD) method to perturbatively include connected triple excitations is reported. The development is based on the concept of triples-natural orbitals that span the joint space of the three pair natural orbital (PNO) spaces of the three electron pairs that are involved in the calculation of a given triple-excitation contribution. The truncation error is very smooth and can be significantly reduced through extrapolation to the zero threshold. However, the extrapolation procedure does not improve relative energies. The overall computational effort of the method is asymptotically linear with the system size O(N). Actual linear scaling has been confirmed in test calculations on alkane chains. The accuracy of the DLPNO-CCSD(T) approximation relative to semicanonical CCSD(T0) is comparable to the previously developed DLPNO-CCSD method relative to canonical CCSD. Relative energies are predicted with an average error of approximately 0.5 kcal∕mol for a challenging test set of medium sized organic molecules. The triples correction typically adds 30%-50% to the overall computation time. Thus, very large systems can be treated on the basis of the current implementation. In addition to the linear C150H302 (452 atoms, >8800 basis functions) we demonstrate the first CCSD(T) level calculation on an entire protein, Crambin with 644 atoms, and more than 6400 basis functions.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. The Journal of Chemical Physics, 2013 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Alan: Atom ve Molekül Fiziği ve Optik

Atomic and Molecular Physics, and OpticsPhysics and Astronomy