Nature Communications· 2026Q1
Bir Turbalık Mikroorganizma Topluluğunda Biyosentetik Gen Kümelerinin Yüksek Çeşitliliği Ancak Sınırlı İfadesi
High diversity but limited expression of biosynthetic gene clusters in a peatland microbial community
- 0atıf
- Q1SCImago
- 2026yıl
Kısa özet
Turbalık mikroorganizmaları 9.694 çeşitli biyosentetik gen kümesi (BGC) barındırır, ancak bunların yalnızca %9-27'si yerinde aktiftir ve Acidobacteriota, orta düzeyde BGC sayısına rağmen yüksek ifade göstermektedir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Çeşitli turbalık mikroorganizmalarında 9.694 biyosentetik gen kümesi (BGC) tanımlandı.
- Tanımlanan BGC'lerin yalnızca %9-27'si yerinde aktif olarak ifade edilmektedir.
- Orta düzeyde BGC repertuvarlarına rağmen Acidobacteriota, BGC transkripsiyonlarının %50'sinden fazlasını oluşturmaktadır.
- BGC ifadesi, genom başına BGC sayısı ile ters orantılıdır.
- BGC ifadesi, özellikle glikozit hidrolazlar olmak üzere karbonhidrat aktif enzim ifadesiyle güçlü bir şekilde ilişkilidir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Abstract The in situ relevance of biosynthetic gene clusters (BGCs) remains poorly understood. We apply meta-omics to characterize BGC diversity and activity along a peatland redox gradient. From seven metagenomes, we recover 9,694 BGCs, spanning diverse taxa, most lacking close relatives in reference databases, indicating extensive novelty. Only 9-27% of this potential is expressed in situ, with Acidobacteriota, despite moderate repertoires, accounting for over half of all BGC transcription. Talented producers with up to 24 clusters are largely silent, and expression is inversely related to BGCs per genome. Acidobacteriota, specialized in complex carbon processing potential express a larger proportion of their BGC repertoires than BGC-rich Pseudomonadota, which had shorter doubling times and lower potential for complex carbon processing. At the genome level, the degree of BGC expression is most strongly coupled to carbohydrate-active enzyme expression, particularly glycoside hydrolases, linking secondary metabolism to active carbon processing in peatland microbes. Thus, although BGCs are widespread, BGC expression in situ is integrated into the carbon-cycling activity of individual taxa rather than a shared physiological state.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nature Communications, 2026 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Farmakoloji (Tıp)
PharmacologyMedicine