Analytical Chemistry· 2026Q1
IMSS: Sikelipeptit Keşfi İçin Entegre Kütle Spektrometrisi Stratejisi
IMSS: An Integrated Mass Spectrometry Strategy for Targeted Discovery of CyclopeptidesExemplified by Phakellicyclins from the Marine Sponge Phakellia fusca
- 0atıf
- Q1SCImago
- 2026yıl
Kısa özet
Entegre bir kütle spektrometrisi stratejisi (IMSS), deniz süngeri Phakellia fusca'dan iki yeni anti-inflamatuar fakellisiklinin keşfiyle örneklendirilen, sikelipeptitlerin seçici tespitini, annotasyonunu ve hedeflenmiş izolasyonunu sağlamaktadır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Sikelipeptitlerin seçici tespiti, annotasyonu ve hedeflenmiş izolasyonu için entegre bir kütle spektrometrisi stratejisi (IMSS) geliştirilmiştir.
- IMSS, multiplexed NL/PI taraması, de novo dizileme (CycloNovo), çift dereplikasyon (GNPS + kütüphane) ve MS tetiklemeli otomatik saflaştırmayı içermektedir.
- Phakellia fusca'ya uygulama, 23 aday CP'yi ortaya çıkarmış ve iki yeni siklooktapeptit, fakellisiklin A ve B'yi izole etmiştir.
- Fakellisiklin A ve B, belirgin sitotoksisite olmaksızın seçici IL-6 inhibisyonu yoluyla güçlü anti-inflamatuar aktivite sergilemektedir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Abstract Cyclopeptides (CPs) represent a structurally diverse class of bioactive natural products but remain analytically challenging due to their high structural similarity, low abundance, and complex matrices. Herein, we report an integrated mass spectrometry strategy (IMSS) enabling selective detection, annotation, and targeted isolation of CPs from marine organisms. The workflow incorporates: (1) multiplexed diagnostic neutral loss and precursor ion (NL/PI) scanning based on the six most frequent amino acid residues (Pro, Ile/Leu, Val, Tyr, Phe, Trp) identified from 16 reference standards; (2) de novo sequencing-assisted spectral validation via CycloNovo; (3) dual dereplication combining GNPS molecular networking with a curated library of 538 marine CPs; and (4) MS-triggered automated purification for target-oriented isolation. When applied to the marine sponge Phakellia fusca, IMSS afforded 23 candidate CPs and allowed targeted purification of two unknown cyclooctapeptides, phakellicyclins A and B, featuring rare dioxindolylalanine and β-3-oxindolylalanine residues, respectively. Both compounds exhibited potent anti-inflammatory activity through selective inhibition of interleukin-6 (IL-6) production without obvious cytotoxicity. This study establishes a robust and reproducible MS workflow for the targeted discovery of Pro/Ile/Leu-enriched marine CPs, with demonstrated potential for adaptation to other CP classes.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Analytical Chemistry, 2026 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
BiotechnologyBiochemistry, Genetics and Molecular Biology