PofoliaPofolia ile paylaşıldı

· 2019

Makromoleküler yapı belirleme X-ışınları, nötronlar ve elektronlar kullanılarak: Phenix'teki son gelişmeler.

Macromolecular structure determination using X-rays, neutrons and electrons: recent developments in Phenix.

Liebschner, Dorothee, Afonine, Pavel V, Baker, Matthew L, Bunkóczi, Gábor ve diğerleri

Kısa özet

Phenix yazılım paketi, X-ışını, nötron, elektron kırınımı ve kriyo-elektron mikroskobu verilerini kullanarak makromoleküler yapı belirlemesini destekleyecek şekilde güncellenmiştir.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • Phenix yazılımı artık X-ışını, nötron ve elektron kırınımı verilerinin yanı sıra kriyo-elektron mikroskobu verilerini de desteklemektedir.
  • Yazılım, veri kalitesi değerlendirmesi, harita iyileştirme, model oluşturma ve iyileştirme gibi görevleri yerine getirir.
  • Tekrarlayan görevlerin otomatikleştirilmesine ve varsayılan parametreler aracılığıyla en iyi uygulamaların teşvik edilmesine vurgu yapılmaktadır.
  • Komut satırı özelliklerine erişimi basitleştiren ve projeleri yöneten bir grafik kullanıcı arayüzü mevcuttur.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

Diffraction (X-ray, neutron and electron) and electron cryo-microscopy are powerful methods to determine three-dimensional macromolecular structures, which are required to understand biological processes and to develop new therapeutics against diseases. The overall structure-solution workflow is similar for these techniques, but nuances exist because the properties of the reduced experimental data are different. Software tools for structure determination should therefore be tailored for each method. Phenix is a comprehensive software package for macromolecular structure determination that handles data from any of these techniques. Tasks performed with Phenix include data-quality assessment, map improvement, model building, the validation/rebuilding/refinement cycle and deposition. Each tool caters to the type of experimental data. The design of Phenix emphasizes the automation of procedures, where possible, to minimize repetitive and time-consuming manual tasks, while default parameters are chosen to encourage best practice. A graphical user interface provides access to many command-line features of Phenix and streamlines the transition between programs, project tracking and re-running of previous tasks.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır., 2019

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Alan: Arkeoloji (Sosyal Bilimler)

ArcheologySocial Sciences