PofoliaPofolia ile paylaşıldı

Acta Crystallographica Section D Structural Biology· 2019Q1

X-ışınları, nötronlar ve elektronlar kullanılarak makromoleküler yapı tayini: Phenix'teki son gelişmeler

Macromolecular structure determination using X-rays, neutrons and electrons: recent developments in <i>Phenix</i>

Dorothée Liebschner, Pavel V. Afonine, Matthew L. Baker, Gàbor Bunkòczi ve diğerleri

Kısa özet

Phenix yazılım paketi, makromoleküler yapı tayini için X-ışını, nötron ve elektron kırınımının yanı sıra kriyojenik elektron mikroskobu verilerini işlemek üzere güncellenmiştir.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • Phenix yazılımı artık X-ışını, nötron, elektron kırınımı ve kriyojenik elektron mikroskobu verilerini entegre etmektedir.
  • Araçlar, her deneysel veri türünün benzersiz özelliklerine göre özelleştirilmiştir.
  • Yapı tayinindeki tekrarlayan görevlerin otomasyonuna vurgu yapılmaktadır.
  • Grafiksel bir kullanıcı arayüzü, komut satırı özelliklerine erişimi ve proje yönetimini basitleştirmektedir.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

Diffraction (X-ray, neutron and electron) and electron cryo-microscopy are powerful methods to determine three-dimensional macromolecular structures, which are required to understand biological processes and to develop new therapeutics against diseases. The overall structure-solution workflow is similar for these techniques, but nuances exist because the properties of the reduced experimental data are different. Software tools for structure determination should therefore be tailored for each method. Phenix is a comprehensive software package for macromolecular structure determination that handles data from any of these techniques. Tasks performed with Phenix include data-quality assessment, map improvement, model building, the validation/rebuilding/refinement cycle and deposition. Each tool caters to the type of experimental data. The design of Phenix emphasizes the automation of procedures, where possible, to minimize repetitive and time-consuming manual tasks, while default parameters are chosen to encourage best practice. A graphical user interface provides access to many command-line features of Phenix and streamlines the transition between programs, project tracking and re-running of previous tasks.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Acta Crystallographica Section D Structural Biology, 2019 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Alan: Malzeme Kimyası

Materials ChemistryMaterials Science