Nucleic Acids Research· 2025Q1
ProteomeXchange Konsorsiyumu 2026'da: Proteomik Verileri ANLAŞILIR Hale Getirmek
The ProteomeXchange consortium in 2026: making proteomics data FAIR
- 62atıf
- Q1SCImago
- 2025yıl
Kısa özet
ProteomeXchange, son 3 yılda 30.097 veri seti eklenerek veri gönderimini hızlandırmış, Haziran 2025'e kadar toplam 64.330 veri setine ulaşmış ve veri standartları desteğini iyileştirerek veri yeniden kullanımını artırmıştır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- ProteomeXchange, Haziran 2022 ile Haziran 2025 arasında 30.097 yeni veri seti alarak toplam 64.330 veri setine katkıda bulunmuştur.
- Evrensel Spektrum Tanımlayıcıları ve SDRF-Proteomik gibi Proteomik Standartlar Girişimi standartlarını desteklemek üzere iyileştirmeler yapılmıştır.
- Halka açık veri setleri yeniden analiz ve yeni makine öğrenmesi yaklaşımları için kullanılarak veri yeniden kullanımı artmıştır.
- Gelecekteki gelişmeler, kontrollü erişime sahip insan proteomik verileri ve MS-dışı proteomik yöntemlere odaklanacaktır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
The ProteomeXchange consortium of proteomics resources (http://www.proteomexchange.org) was established to standardize open data practices in the mass spectrometry (MS)-based proteomics field. Here, we describe the main developments in ProteomeXchange in the last 3 years. The six member databases of ProteomeXchange, spread out in three different continents, are the PRIDE database, PeptideAtlas, MassIVE, jPOST, iProX, and Panorama Public. We provide updated data submission statistics, showcasing that the number of datasets submitted to ProteomeXchange resources has continued to accelerate every year. Through June 2025, 64 330 datasets had been submitted to ProteomeXchange resources, and from those, 30 097 (47%) just in the last 3 years. We also report on the improvements in the support for the standards developed by the Proteomics Standards Initiative, e.g. for Universal Spectrum Identifiers and for SDRF (Sample and Data Relationship Format)-Proteomics. Additionally, we highlight the increase in data reuse activities of public datasets, including targeted reanalyses of datasets of different proteomics data types, and the development of novel machine learning approaches. Finally, we summarize our plans for the near future, covering the development of resources for controlled-access human proteomics data, and for the support of non-MS proteomics approaches.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nucleic Acids Research, 2025 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Spektroskopi
SpectroscopyChemistry