Spektroskopi alanında öne çıkan makaleler
Pofolia’nın havuzunda Spektroskopi alt dalından 70 makale var (2012–2025). Aşağıdaki liste en çok atıf alandan başlar.
En çok atıf alanlar
Sıralama atıf sayısına göre. Atıf zamanla biriktiği için bu liste doğal olarak birkaç yıl önce yayımlanmış çalışmalara ağırlık verir; alanın bugünü için “son eklenenler” bölümüne bak.
GROMACS: Dizüstü bilgisayarlardan süper bilgisayarlara çok seviyeli paralellik yoluyla yüksek performanslı moleküler simülasyonlar
GROMACS: High performance molecular simulations through multi-level parallelism from laptops to supercomputers
SoftwareX · 2015 · Q2 · 27.148 atıf · Açık erişim
GROMACS sürüm 5, SIMD, çoklu iş parçacığı, CPU-GPU hızlandırma, etki alanı ayrıştırma ve topluluk düzeyinde paralellik arasında çok seviyeli paralelleştirme algoritmaları uygulayarak moleküler simülasyonlarda yeni performans zirvelerine ulaşıyor.
İnsan proteomunun doku bazlı haritası
Tissue-based map of the human proteome
Science · 2015 · Q1 · SJR 10.00 · FWCI 374.62 · 16.073 atıf
Araştırmacılar, entegre bir omik yaklaşımı kullanarak 32 doku ve organdaki protein varlığını ve lokalizasyonunu detaylandıran kapsamlı bir insan doku proteomu haritası oluşturdular.
HITRAN2020 Moleküler Spektroskopik Veritabanı
The HITRAN2016 molecular spectroscopic database
Journal of Quantitative Spectroscopy and Radiative Transfer · 2017 · Q1 · FWCI 292.66 · 7.955 atıf
Gaz ortamlarında ışık iletimini ve emisyonunu simüle etmek için kritik bir kaynak olan HITRAN2020 moleküler spektroskopik veritabanı, atmosferik emiciler için doğruluğu artıran ve spektral kapsamı genişleten yeni deneysel ve teorik verilerle önemli ölçüde güncellenmiştir.
PTRAJ ve CPPTRAJ: Moleküler Dinamik Yörünge Verilerinin İşlenmesi ve Analizi İçin Yazılımlar
PTRAJ and CPPTRAJ: Software for Processing and Analysis of Molecular Dynamics Trajectory Data
Journal of Chemical Theory and Computation · 2013 · Q1 · SJR 1.00 · FWCI 61.99 · 7.622 atıf
Tamamlayıcı, ücretsiz olarak sunulan iki yazılım paketi olan PTRAJ ve onun ardılı CPPTRAJ, moleküler dinamik yörünge verilerinin işlenmesi ve analizi için tanıtılmaktadır.
PRIDE veritabanı ve ilgili araçlar ve kaynaklar 2019'da: kantifikasyon verileri için desteğin iyileştirilmesi
The PRIDE database and related tools and resources in 2019: improving support for quantification data
Nucleic Acids Research · 2018 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 493.21 · 7.443 atıf · Açık erişim
Kütle spektrometrisi tabanlı proteomik veriler için büyük bir depo olan PRIDE veritabanı, yeni bir mimari ve mzTab formatı aracılığıyla kantitatif veriler için geliştirilmiş destekle önemli ölçüde yükseltildi.
PRIDE veritabanı kaynakları 2022'de: kütle spektrometrisi tabanlı proteomik kanıtlar için bir merkez
The PRIDE database resources in 2022: a hub for mass spectrometry-based proteomics evidences
Nucleic Acids Research · 2021 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 518.31 · 6.779 atıf · Açık erişim
Kütle spektrometrisi proteomik verileri için önde gelen bir depo olan PRIDE veritabanı, 2019'dan bu yana kaynaklarını ve altyapısını önemli ölçüde genişletti. Ayda ortalama yaklaşık 500 veri seti işliyor ve PRIDE Spectra Arşivi aracılığıyla kütle spektrumlarına doğrudan erişim sunuyor.
Gecikmeli Normalizasyon ve Maksimal Peptit Oranı Çıkarımı ile Adlandırılan MaxLFQ ile Doğru Proteom-Geniş Ölçekli Etiketsiz Kantifikasyon
Accurate Proteome-wide Label-free Quantification by Delayed Normalization and Maximal Peptide Ratio Extraction, Termed MaxLFQ
Molecular & Cellular Proteomics · 2014 · Q1 · SJR 2.00 · FWCI 98.97 · 5.556 atıf · Açık erişim
MaxLFQ adı verilen yeni bir yöntem, mevcut MS sinyallerinin maksimum kullanımını sağlayarak ve yeni bir normalizasyon stratejisi kullanarak tüm proteomlar genelinde doğru ve sağlam etiketsiz protein miktar tayinini mümkün kılar.
ORCA kuantum kimya program paketi
The ORCA quantum chemistry program package
The Journal of Chemical Physics · 2020 · Q1 · FWCI 187.33 · 5.072 atıf · Açık erişim
ORCA program paketi, kimya ve ilgili alanlarda teorik araştırmalar için kapsamlı, genel amaçlı bir yazılımdır ve geniş bir hesaplama yöntemi yelpazesi ile benzersiz uygulamalar sunar.
PRIDE veritabanı ve ilgili araçlarının 2016 güncellemesi
2016 update of the PRIDE database and its related tools
Nucleic Acids Research · 2015 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 263.12 · 3.668 atıf · Açık erişim
Kütle spektrometrisi proteomik verileri için önde gelen bir depo olan PRIDE Archive, yeni bir depolama arka ucu, gönderim sistemi ve web arayüzü ile yeniden geliştirildi, önemli veri standartlarını destekliyor ve veri gönderimlerinde önemli bir artış görüyor.
Hirshfeld bölümlemesine dayalı bağımsız gradyan modeli: Kimyasal sistemlerdeki etkileşimlerin görsel çalışması için yeni bir yöntem
Independent gradient model based on Hirshfeld partition: A new method for visual study of interactions in chemical systems
Journal of Computational Chemistry · 2022 · Q1 · SJR 1.00 · FWCI 274.81 · 3.599 atıf
Hirshfeld bölümlemesi ile elektron yoğunluğunu kullanarak kimyasal etkileşimleri görselleştirmek için mevcut Bağımsız Gradyan Modeli'ni (IGM) geliştiren yeni bir yöntem olan IGMH, daha net ve daha doğru grafiksel temsiller sağlamaktadır.
PhosphoSitePlus, 2014: mutasyonlar, PTM'ler ve yeniden kalibrasyonlar
PhosphoSitePlus, 2014: mutations, PTMs and recalibrations
Nucleic Acids Research · 2014 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 57.85 · 3.484 atıf · Açık erişim
PhosphoSitePlus bilgi tabanı artık, yeniden analiz edilmiş ve güvenilirliği artırılmış kütle spektrometrisi verilerinden elde edilen %95'in üzerindeki verilerle 330.000'den fazla memeli post-translasyonel modifikasyonunu (PTM) içermektedir.
İnsan proteomunun bir alt hücresel haritası
A subcellular map of the human proteome
Science · 2017 · Q1 · SJR 10.00 · FWCI 121.88 · 3.004 atıf
Araştırmacılar, 12.003 insan proteininin 30 alt hücresel yapıdaki dağılımını detaylandıran kapsamlı bir görüntü tabanlı harita olan Hücre Atlası'nı oluşturarak hücresel mimari anlayışımızı önemli ölçüde ilerletti.
Veri Bağımsız Edinime Dayalı MS/MS Spektrumlarının Hedefli Veri Çıkarımı: Tutarlı ve Doğru Proteom Analizi İçin Yeni Bir Konsept
Targeted Data Extraction of the MS/MS Spectra Generated by Data-independent Acquisition: A New Concept for Consistent and Accurate Proteome Analysis
Molecular & Cellular Proteomics · 2012 · Q1 · SJR 2.00 · FWCI 66.21 · 3.001 atıf · Açık erişim
Yeni bir strateji, veri bağımsız edinime (DIA) dayalı kütle spektrometrisi verilerini parçalanma iyonu spektral kütüphaneleri kullanarak analiz eder, bu da geniş proteomlarda tutarlı ve doğru peptit miktar tayinine olanak tanır.
Canlı Sistemlerde Metal İyonlarını Ölçmek İçin Floresan Sensörler
Fluorescent Sensors for Measuring Metal Ions in Living Systems
Chemical Reviews · 2014 · Q1 · SJR 16.00 · FWCI 94.93 · 2.440 atıf · Açık erişim
Bu derleme, canlı biyolojik sistemlerdeki metal iyonlarını tespit etmek ve ölçmek için tasarlanmış floresan sensörlerdeki en son gelişmeleri sentezlemektedir.
InterPro protein aileleri ve alanları veritabanı: 20 yıl sonra
The InterPro protein families and domains database: 20 years on
Nucleic Acids Research · 2020 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 147.80 · 2.420 atıf
Protein sınıflandırması için kapsamlı bir kaynak olan InterPro veritabanı, içeriğinde ve ilgili yazılımlarında önemli güncellemelerle 20. faaliyet yılına ulaşmıştır.
HITRAN2020 moleküler spektroskopik veritabanı
The HITRAN2020 molecular spectroscopic database
Journal of Quantitative Spectroscopy and Radiative Transfer · 2021 · Q1 · FWCI 139.61 · 2.387 atıf
Moleküler spektroskopik parametreler için standart olan HITRAN veritabanının büyük bir güncellemesi olan HITRAN2020, yeni moleküller, izotopologlar ve titreşim bantları ekleyerek spektral kapsama alanını ve bütünlüğü önemli ölçüde genişletiyor.
Hızlı kuantum kimyasal yöntemlerle düşük enerjili kimyasal uzayın otomatik keşfi
Automated exploration of the low-energy chemical space with fast quantum chemical methods
Physical Chemistry Chemical Physics · 2020 · Q2 · FWCI 97.61 · 2.342 atıf
Hızlı yarı-ampirik kuantum kimyası (GFn-xTB) ve meta-dinamik kullanan yeni bir hesaplama şeması, büyük moleküllerin düşük enerjili kimyasal uzayını verimli bir şekilde keşfederek konformerlerin termodinamik topluluklarını üretir.
iProX: entegre bir proteom kaynağı
iProX: an integrated proteome resource
Nucleic Acids Research · 2018 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 60.50 · 2.038 atıf · Açık erişim
iProX, kütle spektrometrisi tabanlı deneylerden elde edilen ham proteom verilerinin, analiz sonuçlarının ve meta verilerin dünya çapında erişimini ve paylaşımını kolaylaştırmak için geliştirilmiş yeni bir kamu platformudur.
Floresan kemisensörler: geçmiş, bugün ve gelecek
Fluorescent chemosensors: the past, present and future
Chemical Society Reviews · 2017 · Q1 · SJR 11.00 · FWCI 82.99 · 1.978 atıf · Açık erişim
Bu derleme, biyoloji, fizyoloji, farmakoloji ve çevre bilimleri gibi alanlarda geniş uygulamaları olan floresan kemisensörlerin 150 yıllık geçmişini ve önemli gelişmelerini ele almaktadır.
Proteomik Tanımlamaları (PRIDE) veritabanı ve ilgili araçlar: 2013 durumu
The Proteomics Identifications (PRIDE) database and associated tools: status in 2013
Nucleic Acids Research · 2012 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 114.22 · 1.972 atıf · Açık erişim
Kütle spektrometrisi tabanlı proteomik verileri için önde gelen bir depo olan PRIDE veritabanı, içeriğine ilişkin yeni istatistikler ve gönderim ile analiz araçlarının açıklamalarıyla güncellenmiştir.
Son eklenenler
100 kHz Yüksek Frekanslı Kuvars Ayar Çatalına Dayalı Hızlı Adım Heterodin Işık Uyarılı Termoelastik Spektroskopi Gaz Algılama
Fast step heterodyne light-induced thermoelastic spectroscopy gas sensing based on a quartz tuning fork with high-frequency of 100 kHz
Opto-Electronic Advances · 2025 · Q1 · SJR 3.00 · FWCI 29.10 · 62 atıf · Açık erişim
Yeni bir gaz sensörü, on kat daha hızlı tepki süresi elde etmek için yüksek frekanslı bir kuvars ayar çatalı (~100 kHz) kullanır ve standart sensörlere göre önemli bir gelişme olan 33 ms gibi kısa ölçüm döngülerine olanak tanır.
Çok amaçlı algoritma ile tasarlanmış ultra-yoğun nokta desenli çok geçişli hücreye dayalı ultra-yüksek hassasiyetli LITES sensörü
An ultra-highly sensitive LITES sensor based on multi-pass cell with ultra-dense spot pattern designed by multi-objective algorithm
PhotoniX · 2025 · Q1 · SJR 3.00 · FWCI 26.76 · 57 atıf · Açık erişim
Araştırmacılar, ultra-yoğun nokta desenli yeni bir çok geçişli hücre (MPC) kullanarak ultra-yüksek hassasiyetli Işık Uyarılmış Termoelastik Spektroskopi (LITES) sensörü geliştirdi ve bu sensörle asetilen için minimum tespit limiti (MDL) 4,78 ppb'ye ulaştı.
Hirshfeld bölümlemesine dayalı bağımsız gradyan modeli: Kimyasal sistemlerdeki etkileşimlerin görsel çalışması için yeni bir yöntem
Independent gradient model based on Hirshfeld partition: A new method for visual study of interactions in chemical systems
Journal of Computational Chemistry · 2022 · Q1 · SJR 1.00 · FWCI 274.81 · 3.599 atıf
Hirshfeld bölümlemesi ile elektron yoğunluğunu kullanarak kimyasal etkileşimleri görselleştirmek için mevcut Bağımsız Gradyan Modeli'ni (IGM) geliştiren yeni bir yöntem olan IGMH, daha net ve daha doğru grafiksel temsiller sağlamaktadır.
iProX 2021'de: proteomik veri paylaşımını büyük veriyle bağlamak
iProX in 2021: connecting proteomics data sharing with big data
Nucleic Acids Research · 2021 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 69.37 · 1.115 atıf · Açık erişim
Entegre proteom kaynağı iProX, 2021'de proteomik veri kümeleri için PB düzeyinde depolama ve saniye düzeyinde sorgu gecikmesi sağlayan bir büyük veri platformu başlattı.
PRIDE veritabanı kaynakları 2022'de: kütle spektrometrisi tabanlı proteomik kanıtlar için bir merkez
The PRIDE database resources in 2022: a hub for mass spectrometry-based proteomics evidences
Nucleic Acids Research · 2021 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 518.31 · 6.779 atıf · Açık erişim
Kütle spektrometrisi proteomik verileri için önde gelen bir depo olan PRIDE veritabanı, 2019'dan bu yana kaynaklarını ve altyapısını önemli ölçüde genişletti. Ayda ortalama yaklaşık 500 veri seti işliyor ve PRIDE Spectra Arşivi aracılığıyla kütle spektrumlarına doğrudan erişim sunuyor.
Bu alanı günlük akışına ekle
İlgi alanlarını seç, her gün alanındaki yeni makaleler Türkçe özetleriyle önüne gelsin. Özetlerin tamamı uygulamada.
Uygulamayı aç