Journal of Cheminformatics· 2026Q1
Kimyasal Reaksiyonların Parmak İzi Alanında Filtreleme ve Sınıflandırma İçin Temsili
Representing chemical and enzymatic reactions in fingerprint space for applicability filtering and classification
- 1atıf
- Q1SCImago
- 2026yıl
Kısa özet
Yeni bir çerçeve, ürün ve substrat parmak izleri arasındaki farkları temsil ederek kimyasal ve enzimatik reaksiyonları parmak izi alanına eşler ve filtreleme ile sınıflandırmayı mümkün kılar.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Reaksiyonlar, ürün ve substrat parmak izleri arasındaki işaretli fark olarak parmak izi alanında temsil edilir.
- ECFP uyumlu şablonlar, sabit parmak izi yer değiştirmeleri oluşturarak funktoriyel bir eşleme sağlar.
- Reaksiyon merkezi ECFP'leri, yerel ortamları kodlar ve reaksiyon uygulanabilirliği için bir ön filtre görevi görür.
- Çerçeve, USPTO-50k ve MetaNetX veri kümeleri kullanılarak reaksiyon ve enzim sınıflarını başarıyla sınıflandırır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Abstract Molecular and reaction fingerprints are widely used as static descriptors, but their relationship to graph-level reaction application remains unclear. We address this question in counted Extended-Connectivity Fingerprint (ECFP) space, representing reactions as signed differences between product and substrate fingerprints. We define ECFP-compatible templates, for which graph-level reaction application induces a constant fingerprint displacement, yielding a functorial mapping from graph transformations to affine translations in fingerprint space. We also introduce reaction-center ECFPs to encode the local environments required for template application and to provide a fast coordinate-wise prefilter for graph-level reaction applicability. We evaluate this framework on USPTO-50k and MetaNetX reactions across a range of ECFP radii. Both representations carry predictive information for reaction-class and enzyme-class classification, with reaction-center ECFPs contributing information not captured by reaction ECFPs alone. This framework connects reaction templates and reaction fingerprints to molecular pathway search and reaction-property prediction in fingerprint space.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Journal of Cheminformatics, 2026 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Drug DiscoveryPharmacology, Toxicology and Pharmaceutics