PofoliaPofolia ile paylaşıldı

Molecular Biology and Evolution· 2026Q1

IQ-TREE 3: Karmaşık Modellerle Daha Hızlı Filogenetik Analiz

IQ-TREE 3: phylogenomic inference software using complex evolutionary models

Thomas K. F. Wong, Nhan Ly-Trong, Huaiyan Ren, Piyumal Demotte ve diğerleri

Kısa özet

Popüler filogenetik yazılımının önemli bir güncellemesi olan IQ-TREE 3, artık karmaşık evrimsel modeller kullanarak genetik ağaçları çıkarıyor ve genetik bölgeler arasındaki uyumsuzluğu ölçüyor.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • IQ-TREE 3, filogenetik çıkarım için bölümlenmiş modellere alternatif olarak karışım modelleri sunar.
  • Yeni gen ve bölge uyum faktörleri, genomik bölgeler arasındaki uyumsuzluğu ölçer.
  • Yazılım artık filogenomik ayrışma zamanı tahmini ile entegre edilmiştir.
  • IQ-TREE 3'e tam özellikli bir dizi oluşturucu dahildir.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

IQ-TREE (https://iqtree.github.io/) is a widely used open-source software tool for efficiently inferring phylogenetic trees under maximum likelihood. Here, we present IQ-TREE version 3, the third major release of the software. IQ-TREE 3 significantly extends version 2 with new features, including mixture models as an alternative to partitioned models, gene and site concordance factors to quantify discordance between genomic regions, integration with phylogenomic divergence time estimation, and a fully featured sequence simulator. The IQ-TREE 3 source code is available at https://github.com/iqtree/iqtree3.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Molecular Biology and Evolution, 2026 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Alan: Genetik (Biyokimya, Genetik ve Moleküler Biyoloji) Moleküler Biyoloji

Molecular BiologyBiochemistry, Genetics and Molecular BiologyGenetics