PofoliaPofolia ile paylaşıldı

Journal of Chemical Information and Modeling· 2015Q1

DataWarrior: Kimya Farkındalığına Sahip Veri Görselleştirme İçin Açık Kaynaklı Araç

DataWarrior: An Open-Source Program For Chemistry Aware Data Visualization And Analysis

Thomas Sander, Joël Freyss, Modest von Korff, Christian Rufener

Kısa özet

DataWarrior, kimyagerlerin büyük veri kümelerini moleküler yapılar, özellikler ve yapısal değişiklikler arasındaki korelasyonları belirleyerek yorumlamalarını sağlayan, kimya farkındalığına sahip veri görselleştirme ve analizi sunan yeni bir açık kaynaklı programdır.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • DataWarrior, kimya farkındalığına sahip veri görselleştirme ve analizi için tasarlanmış açık kaynaklı bir programdır.
  • Moleküler aileleri, yapısal motifleri ve özellik değişikliklerini ilişkilendirerek büyük veri kümelerinin yorumlanmasına yardımcı olur.
  • Vektör tabanlı veya vektör tabanlı olmayan tanımlayıcıları kullanan denetimsiz, 2B ölçeklendirme algoritması içerir.
  • Kimyasal uzay, aktivite manzaraları ve aktivite uçurumlarının etkileşimli keşfini sağlar.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

Drug discovery projects in the pharmaceutical industry accumulate thousands of chemical structures and ten-thousands of data points from a dozen or more biological and pharmacological assays. A sufficient interpretation of the data requires understanding, which molecular families are present, which structural motifs correlate with measured properties, and which tiny structural changes cause large property changes. Data visualization and analysis software with sufficient chemical intelligence to support chemists in this task is rare. In an attempt to contribute to filling the gap, we released our in-house developed chemistry aware data analysis program DataWarrior for free public use. This paper gives an overview of DataWarrior's functionality and architecture. Exemplarily, a new unsupervised, 2-dimensional scaling algorithm is presented, which employs vector-based or nonvector-based descriptors to visualize the chemical or pharmacophore space of even large data sets. DataWarrior uses this method to interactively explore chemical space, activity landscapes, and activity cliffs.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Journal of Chemical Information and Modeling, 2015 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Alan: Hesaplamalı Kuram ve Matematik

Computational Theory and MathematicsComputer Science