Hesaplamalı Kuram ve Matematik alanında öne çıkan makaleler
Pofolia’nın havuzunda Hesaplamalı Kuram ve Matematik alt dalından 74 makale var (2012–2026). Aşağıdaki liste en çok atıf alandan başlar.
En çok atıf alanlar
Sıralama atıf sayısına göre. Atıf zamanla biriktiği için bu liste doğal olarak birkaç yıl önce yayımlanmış çalışmalara ağırlık verir; alanın bugünü için “son eklenenler” bölümüne bak.
SwissADME: küçük moleküllerin farmakokinetik, ilaç benzerliği ve tıbbi kimya dostluğunu değerlendirmek için ücretsiz bir web aracı
SwissADME: a free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules
Scientific Reports · 2017 · Q1 · FWCI 340.43 · 17.339 atıf · Açık erişim
Farmakokinetik ve ilaç benzerliği gibi temel ilaç özelliklerini küçük moleküller için hesaplama modellerini kullanarak hızlı bir şekilde tahmin etmek üzere yeni bir ücretsiz web aracı olan SwissADME geliştirilmiştir.
DrugBank 5.0: 2018 Yılı İçin DrugBank Veritabanında Büyük Bir Güncelleme
DrugBank 5.0: a major update to the DrugBank database for 2018
Nucleic Acids Research · 2017 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 409.07 · 8.859 atıf · Açık erişim
Kapsamlı ilaç bilgi veritabanı DrugBank'in önemli bir yükseltmesi olan DrugBank 5.0, birçok alanda içeriğini %100 veya daha fazla genişletmiş olup, ilaç-ilaç etkileşimlerinde yaklaşık %600'lük bir artış sağlamıştır.
Hiper-parametre optimizasyonu için rastgele arama
Random search for hyper-parameter optimization
2012 · FWCI 113.55 · 7.939 atıf
Rastgele arama, hiper-parametre optimizasyonu için ampirik ve teorik olarak grid aramadan daha verimlidir ve daha az hesaplama süresinde eşit derecede iyi veya daha iyi modeller bulur.
AutoDock Vina 1.2.0: Yeni Yerleştirme Yöntemleri, Genişletilmiş Kuvvet Alanı ve Python Bağlantıları
AutoDock Vina 1.2.0: New Docking Methods, Expanded Force Field, and Python Bindings
Journal of Chemical Information and Modeling · 2021 · Q1 · SJR 1.00 · FWCI 405.50 · 6.839 atıf
AutoDock Vina 1.2.0 artık makrosiklus ve açık su molekülü modellemesini destekleyerek, diğer AutoDock programlarına kıyasla önceki bir sınırlamayı gidermiştir.
Referans Noktası Tabanlı Baskın Olmayan Sıralama Yaklaşımını Kullanan Evrimsel Bir Çok Amaçlı Optimizasyon Algoritması, Bölüm I: Kutu Kısıtlamalı Problemlerin Çözümü
An Evolutionary Many-Objective Optimization Algorithm Using Reference-Point-Based Nondominated Sorting Approach, Part I: Solving Problems With Box Constraints
IEEE Transactions on Evolutionary Computation · 2013 · Q1 · SJR 3.00 · FWCI 126.54 · 6.837 atıf
Çok sayıda amaçlı optimizasyon problemleri (4+ amaçlı) için yeni bir evrimsel algoritma olan NSGA-III önerilmiştir ve 15'e kadar amaçlı test problemlerinde mevcut yöntemlerden daha iyi performans göstermiştir.
PubChem Madde ve Bileşik veritabanları
PubChem Substance and Compound databases
Nucleic Acids Research · 2015 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 318.36 · 5.504 atıf · Açık erişim
Kimyasal madde ve biyolojik aktivite verileri için halka açık bir depo olan PubChem, 2004'teki lansmanından bu yana önemli ölçüde büyüyerek artık araştırmacılar için önemli bir kaynak olarak hizmet vermektedir.
pkCSM: Grafik Tabanlı İmzalar Kullanarak Küçük Molekül Farmakokinetik ve Toksisite Özelliklerinin Tahmini
pkCSM: Predicting Small-Molecule Pharmacokinetic and Toxicity Properties Using Graph-Based Signatures
Journal of Medicinal Chemistry · 2015 · Q1 · SJR 1.00 · FWCI 40.46 · 5.474 atıf · Açık erişim
Grafik tabanlı imzalar kullanan yeni bir hesaplamalı araç olan pkCSM, mevcut yöntemlere rakip veya onlardan daha iyi performans göstererek temel ilaç farmakokinetik ve toksisite özelliklerini tahmin eder.
MM/PBSA ve MM/GBSA yöntemleri ile ligand-bağlanma afinitelerinin tahmini
The MM/PBSA and MM/GBSA methods to estimate ligand-binding affinities
Expert Opinion on Drug Discovery · 2015 · Q1 · SJR 1.00 · FWCI 155.50 · 5.329 atıf · Açık erişim
MM/PBSA ve MM/GBSA yöntemleri, daha basit veya daha karmaşık yöntemlere kıyasla doğruluk ve hesaplama maliyeti arasında bir denge sunarak ligand-bağlanma afinitelerini tahmin etmek için popülerdir.
TCMSP: bitkisel ilaçlardan ilaç keşfi için sistemik farmakoloji veritabanı
TCMSP: a database of systems pharmacology for drug discovery from herbal medicines
Journal of Cheminformatics · 2014 · Q1 · SJR 1.00 · FWCI 37.39 · 5.064 atıf · Açık erişim
TCMSP veritabanı, Çin bitkisel ilaçlarından ilaç keşfini sağlamak amacıyla farmakokimya, ADME özellikleri, hedefler ve hastalıkları entegre eder.
Değerlendirme: hassasiyetten, hatırlamaya ve F-ölçüsünden ROC'a, bilgililiğe, işaretlenmeye ve korelasyona
Evaluation: from precision, recall and F-measure to ROC, informedness, markedness and correlation
arXiv (Cornell University) · 2020 · 4.431 atıf · Açık erişim
Yaygın olarak kullanılan Hassasiyet, Hatırlama ve F-Ölçüsü gibi değerlendirme metrikleri yanlıdır ve sistem performansını yanlış gösterebilir, daha kötü sistemleri daha iyiymiş gibi gösterebilir.
SwissTargetPrediction: küçük moleküllerin protein hedeflerinin verimli tahmini için güncellenmiş veriler ve yeni özellikler
SwissTargetPrediction: updated data and new features for efficient prediction of protein targets of small molecules
Nucleic Acids Research · 2019 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 191.43 · 4.306 atıf · Açık erişim
Güncellenmiş SwissTargetPrediction web aracı, artık 376.342 bileşik ve 3.068 hedef içeren daha büyük bir veritabanı kullanarak küçük molekül protein hedeflerini tahmin ediyor ve en iyi 15 tahminde en az bir doğru insan hedefini belirlemede %70'in üzerinde doğruluk sağlıyor.
Matris Analizi
Matrix Analysis
Cambridge University Press eBooks · 2012 · FWCI 13.89 · 4.303 atıf
Bu saygın metnin ikinci baskısı, klasik ve güncel sonuçları kanonik formlar aracılığıyla birleştiren, revize edilmiş ve güncellenmiş bir lineer cebir ve matris teorisi incelemesi sunmaktadır.
PubChem 2021'de: yeni veri içeriği ve geliştirilmiş web arayüzleri
PubChem in 2021: new data content and improved web interfaces
Nucleic Acids Research · 2020 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 320.72 · 4.014 atıf · Açık erişim
Büyük bir kimyasal bilgi kaynağı olan PubChem, 100'den fazla yeni kaynağın entegrasyonuyla verilerini önemli ölçüde genişletti ve Periyodik Tablo ve Yol Haritası sayfaları gibi yeni özellikler başlattı.
Kişisel İletişim
Personal Communication
2014 · FWCI 599.33 · 3.824 atıf
Görüntü yoğunluğundan açıklığı belirlemek için, bu iki bileşenin farklı uzamsal dağılımlarından yararlanan yeni bir iki boyutlu yöntem sunulmaktadır.
Optimal Süreçlerin Matematiksel Teorisi
Mathematical Theory of Optimal Processes
2018 · FWCI 55.11 · 3.721 atıf
Bu cilt, klasik varyasyonel problemlerin ötesine geçen geniş bir problem yelpazesi için evrensel bir çözüm olarak maksimum prensibini tanıtmaktadır.
SARS-CoV-2 ana proteazının kristal yapısı, geliştirilmiş α-ketoamid inhibitörlerinin tasarımı için bir temel sağlar
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease provides a basis for design of improved α-ketoamide inhibitors
Science · 2020 · Q1 · SJR 10.00 · FWCI 397.80 · 3.442 atıf · Açık erişim
SARS-CoV-2 ana proteazının (Mpro) kristal yapısı belirlenmiş ve geliştirilmiş bir α-ketoamid inhibitörü ile karmaşık hali ortaya konmuştur. Bu yapısal anlayış, gelişmiş plazma yarı ömrü ve akciğer tropizmi gösteren güçlü Mpro inhibitörlerinin tasarımını mümkün kılar.
PubChem 2019 güncellemesi: kimyasal verilere iyileştirilmiş erişim
PubChem 2019 update: improved access to chemical data
Nucleic Acids Research · 2018 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 314.26 · 3.406 atıf · Açık erişim
PubChem, yeni içerik ve geliştirilmiş web ve programatik arayüzlerle kimyasal verilere erişimi artıran önemli güncellemeler yayınladı.
ZINC 15 – Herkes İçin Ligand Keşfi
ZINC 15 – Ligand Discovery for Everyone
Journal of Chemical Information and Modeling · 2015 · Q1 · SJR 1.00 · FWCI 76.26 · 3.401 atıf
ZINC 15, artık 120 milyondan fazla satın alınabilir bileşiği içeren ve kimya ile biyoloji arasındaki boşluğu kapatmayı amaçlayan, özel bilişim eğitimi olmayan biyologlar için erişilebilir bir ligand veritabanıdır.
Kıyaslar ve Çürütmeler
Conjectures and Refutations
MQUP eBooks · 2020 · FWCI 57.75 · 3.391 atıf
Matematiksel araştırmalarda deneme yanılma yoluyla ortaya atılan varsayımlar (kıyaslar) ve bunların çürütülmesi, sadece kanıtlanamayan teoremler değil, ilerlemenin temel ve rasyonel bir parçasıdır.
Grafiklerde Hakimiyetin Temelleri
Fundamentals of Domination in Graphs
2013 · 3.302 atıf
Bu çalışma, grafiklerde hakimiyetin teorik, algoritmik ve uygulama yönlerini kapsayan ilk kapsamlı genel bakışı sunmaktadır.
Son eklenenler
Verililik, Karşıtlık, Belirlilik, Özneler, Konular ve Bakış Açısı
Givenness, Contrastiveness, Definiteness, Subjects, Topics, and Point of View
2026 · FWCI 314.63 · 1.846 atıf
Bu makale, bir ismin geleneksel dilbilgisel işlevlerin ötesine geçen çok yönlü rollerini inceliyor.
DrugBank 6.0: 2024 İçin Genişletilmiş İlaç Bilgi Tabanı
DrugBank 6.0: the DrugBank Knowledgebase for 2024
Nucleic Acids Research · 2023 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 228.97 · 1.579 atıf · Açık erişim
2024'te yayınlanan DrugBank 6.0, ilaç bilgi tabanını önemli ölçüde genişleterek FDA onaylı ilaçları %72 (4563'e), araştırma aşamasındaki ilaçları %38 (6231'e), ilaç-ilaç etkileşimlerini %300 (1.413.413'e) ve ilaç-gıda etkileşimlerini %200 (2475'e) artırdı.
antiSMASH 7.0: Mikroorganizma Bileşiklerinin Tespit, Regülasyon ve Görselleştirilmesinde Geliştirmeler
antiSMASH 7.0: new and improved predictions for detection, regulation, chemical structures and visualisation
Nucleic Acids Research · 2023 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 332.25 · 2.273 atıf · Açık erişim
antiSMASH 7.0, desteklenen biyosentetik gen kümesi (BGC) türlerini 71'den 81'e çıkararak, kimyasal yapı tahminini iyileştirerek ve enzimatik montaj hattı ile gen kümesi regülasyonunun görselleştirilmesini geliştirerek mikrobiyal genom madenciliğini önemli ölçüde iyileştirir.
Graf Etiketlemenin Dinamik Bir Anketi
A Dynamic Survey of Graph Labeling
The Electronic Journal of Combinatorics · 2022 · Q1 · FWCI 47.58 · 2.190 atıf
Bu anket, 1960'ların ortasından bu yana 3000'den fazla makaleden elde edilen 200'den fazla graf etiketleme tekniğini bir araya getirerek, bu alandaki araştırmaları takip etme zorluğunu ele almaktadır.
PubChem 2023 Güncellemesi: Genişletilmiş Veri ve Yeni Özellikler
PubChem 2023 update
Nucleic Acids Research · 2022 · Q1 · SJR 8.00 · FWCI 367.86 · 3.238 atıf · Açık erişim
PubChem, Google Patent verilerini entegre etti, yeni Hücre Hattı ve Takson veri koleksiyonları oluşturdu, biyolojik test veri modelini güncelledi ve hedef odaklı indirmeler ile yapı standardizasyonu ile programatik erişimi geliştirdi.
Bu alanı günlük akışına ekle
İlgi alanlarını seç, her gün alanındaki yeni makaleler Türkçe özetleriyle önüne gelsin. Özetlerin tamamı uygulamada.
Uygulamayı aç