ACS Central Science· 2017Q1
İlaç Keşfi İçin Tekrarlayan Sinir Ağları ile Odaklanmış Molekül Kütüphaneleri Üretimi
Generating Focused Molecule Libraries for Drug Discovery with Recurrent Neural Networks
- 1.678atıf
- Q1SCImago
- 2017yıl
Kısa özet
Tekrarlayan sinir ağları (RNN'ler), mevcut moleküler yapıları öğrenerek yeni ilaç benzeri moleküller üretebilir ve belirli biyolojik hedeflere karşı test moleküllerinin %14-28'ini yeniden üretebilir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Tekrarlayan sinir ağları (RNN'ler), moleküler yapılar için üretken modeller olarak eğitilir.
- Üretilen moleküllerin özellikleri, eğitim verileriyle iyi korelasyon gösterir.
- Aktif molekül setleriyle RNN'leri ince ayar yapmak, belirli hedefler için üretilen kütüphaneleri zenginleştirir.
- Model, S. aureus'a karşı test moleküllerinin %14'ünü ve P. falciparum'a karşı %28'ini yeniden üretmiştir.
- Skorlama fonksiyonlarıyla birleştirilen RNN'ler, tam de novo ilaç tasarımı döngüsünü gerçekleştirebilir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide In de novo drug design, computational strategies are used to generate novel molecules with good affinity to the desired biological target. In this work, we show that recurrent neural networks can be trained as generative models for molecular structures, similar to statistical language models in natural language processing. We demonstrate that the properties of the generated molecules correlate very well with the properties of the molecules used to train the model. In order to enrich libraries with molecules active toward a given biological target, we propose to fine-tune the model with small sets of molecules, which are known to be active against that target. Against Staphylococcus aureus, the model reproduced 14% of 6051 hold-out test molecules that medicinal chemists designed, whereas against Plasmodium falciparum (Malaria), it reproduced 28% of 1240 test molecules. When coupled with a scoring function, our model can perform the complete de novo drug design cycle to generate large sets of novel molecules for drug discovery.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. ACS Central Science, 2017 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Hesaplamalı Kuram ve Matematik
Computational Theory and MathematicsComputer Science