Nucleic Acids Research· 2017Q1
PharmMapper 2017 güncellemesi: kapsamlı bir hedef farmakofor veritabanı ile potansiyel ilaç hedefi belirleme için bir web sunucusu
PharmMapper 2017 update: a web server for potential drug target identification with a comprehensive target pharmacophore database
- 1.593atıf
- Q1SCImago
- 2017yıl
Kısa özet
Güncellenmiş PharmMapper web sunucusu, artık altı kat daha büyük bir farmakofor veritabanına sahip; bu veritabanı, 16.159 ilaç bağlanabilir ve 51.431 ligand bağlanabilir farmakofor modeli içeren 23.236 protein barındırarak ilaç hedefi belirleme kapsamını önemli ölçüde genişletiyor.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- PharmMapper'ın farmakofor veritabanı altı kat genişleyerek 23.236 proteine ulaştı.
- Veritabanı artık 16.159 ilaç bağlanabilir ve 51.431 ligand bağlanabilir farmakofor modeli içeriyor.
- Kapsam, 110 endikasyondan 450'ye ve 349 moleküler fonksiyondan 4800'e yükseldi.
- Güncellenmiş sunucu, ilaç hedeflerinin istatistiksel olarak anlamlı sıralaması için standart skorlar kullanıyor.
- Geliştirilmiş bir kullanıcı arayüzü de sunuluyor.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
The PharmMapper online tool is a web server for potential drug target identification by reversed pharmacophore matching the query compound against an in-house pharmacophore model database. The original version of PharmMapper includes more than 7000 target pharmacophores derived from complex crystal structures with corresponding protein target annotations. In this article, we present a new version of the PharmMapper web server, of which the backend pharmacophore database is six times larger than the earlier one, with a total of 23 236 proteins covering 16 159 druggable pharmacophore models and 51 431 ligandable pharmacophore models. The expanded target data cover 450 indications and 4800 molecular functions compared to 110 indications and 349 molecular functions in our last update. In addition, the new web server is united with the statistically meaningful ranking of the identified drug targets, which is achieved through the use of standard scores. It also features an improved user interface. The proposed web server is freely available at http://lilab.ecust.edu.cn/pharmmapper/.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nucleic Acids Research, 2017 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Hesaplamalı Kuram ve Matematik
Computational Theory and MathematicsComputer Science