PofoliaPofolia ile paylaşıldı

Journal of Chemical Information and Modeling· 2012Q1

Kimyasal Evren Veritabanı GDB-17'de 166 Milyar Organik Küçük Molekülün Sayımı

Enumeration of 166 Billion Organic Small Molecules in the Chemical Universe Database GDB-17

Lars Ruddigkeit, Ruud van Deursen, Lorenz C. Blum, Jean‐Louis Reymond

Kısa özet

Araştırmacılar, bilinmeyen kimyasal uzayı tanımlamak için 166,4 milyar organik küçük molekülü (C, N, O, S ve halojenlerden 17 atoma kadar) sayarak GDB-17 veritabanını oluşturdular.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • 166,4 milyar organik küçük molekül sayıldı (17 atoma kadar: C, N, O, S, halojenler).
  • Bilinmeyen kimyasal uzayı tanımlamak için GDB-17 veritabanı oluşturuldu.
  • Veritabanı bilinen ilaçların milyonlarca izomerini içeriyor.
  • GDB-17 molekülleri, PubChem moleküllerinden daha zengin aromatik olmayan heterosikller, kuaterner merkezler ve stereoisomerler içeriyor.
  • GDB-17 molekülleri 3B şekil uzayını yoğun bir şekilde dolduruyor ve daha fazla iskelet tipi temsil ediyor.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

Drug molecules consist of a few tens of atoms connected by covalent bonds. How many such molecules are possible in total and what is their structure? This question is of pressing interest in medicinal chemistry to help solve the problems of drug potency, selectivity, and toxicity and reduce attrition rates by pointing to new molecular series. To better define the unknown chemical space, we have enumerated 166.4 billion molecules of up to 17 atoms of C, N, O, S, and halogens forming the chemical universe database GDB-17, covering a size range containing many drugs and typical for lead compounds. GDB-17 contains millions of isomers of known drugs, including analogs with high shape similarity to the parent drug. Compared to known molecules in PubChem, GDB-17 molecules are much richer in nonaromatic heterocycles, quaternary centers, and stereoisomers, densely populate the third dimension in shape space, and represent many more scaffold types.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Journal of Chemical Information and Modeling, 2012 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Alan: Hesaplamalı Kuram ve Matematik

Computational Theory and MathematicsComputer Science