Protein Science· 2023Q1
UCSF ChimeraX: Yapı oluşturma ve analiz araçları
<scp>UCSF ChimeraX</scp>: Tools for structure building and analysis
- 4.277atıf
- Q1SCImago
- 2023yıl
Kısa özet
UCSF ChimeraX, 3-4 Å gibi zorlu çözünürlüklerde büyük moleküler montajların atomik modellemesi için makine öğreniminden yararlanan yeni hesaplamalı araçlar sunarak doğruluğu artırmıştır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- UCSF ChimeraX'in yeni özellikleri, atomik modelleme için makine öğrenimini entegre eder.
- Araçlar, modelleme hatalarını belirlemek için olasılık tabanlı uyum ve kalıntı başına skorlama sunar.
- Mutasyonlar, post-translasyonel modifikasyonlar ve ligand etkileşimleri için geliştirilmiş analiz yetenekleri.
- Elektron mikroskobundan elde edilen 3-4 Å çözünürlükteki moleküler montajlar için artırılmış doğruluk.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Advances in computational tools for atomic model building are leading to accurate models of large molecular assemblies seen in electron microscopy, often at challenging resolutions of 3-4 Å. We describe new methods in the UCSF ChimeraX molecular modeling package that take advantage of machine-learning structure predictions, provide likelihood-based fitting in maps, and compute per-residue scores to identify modeling errors. Additional model-building tools assist analysis of mutations, post-translational modifications, and interactions with ligands. We present the latest ChimeraX model-building capabilities, including several community-developed extensions. ChimeraX is available free of charge for noncommercial use at https://www.rbvi.ucsf.edu/chimerax.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Protein Science, 2023 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Yazılım
SoftwareComputer Science