PofoliaPofolia ile paylaşıldı

Publications of the Astronomical Society of the Pacific· 2013Q1

emcee: MCMC Çekici

<tt>emcee</tt>: The MCMC Hammer

Daniel Foreman-Mackey, David W. Hogg, Dustin Lang, Jonathan Goodman

Kısa özet

Goodman & Weare (2010) tarafından önerilen afin-değişmez topluluk örnekleyicisinin kararlı, iyi test edilmiş bir Python uygulaması olan emcee tanıtılıyor; bu uygulama, geleneksel yöntemlere göre daha az parametre ayarlaması gerektirerek daha iyi performans sunuyor.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • Afin-değişmez topluluk MCMC örnekleyicisinin kararlı bir Python uygulaması olan emcee'yi tanıtıyor.
  • Geleneksel MCMC yöntemlerine kıyasla yalnızca 1-2 parametrenin ayarlanmasını gerektiriyor.
  • Otokorelasyon süresi (bağımsız örnek başına fonksiyon çağrısı) ile ölçülen mükemmel performans elde ediyor.
  • Ek kullanıcı çabası olmadan birden çok CPU çekirdeğinin verimli kullanımını sağlıyor.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

We introduce a stable, well tested Python implementation of the affine-invariant ensemble sampler for Markov chain Monte Carlo (MCMC) proposed by Goodman & Weare (2010). The code is open source and has already been used in several published projects in the astrophysics literature. The algorithm behind emcee has several advantages over traditional MCMC sampling methods and it has excellent performance as measured by the autocorrelation time (or function calls per independent sample). One major advantage of the algorithm is that it requires hand-tuning of only 1 or 2 parameters compared to $\sim N^2$ for a traditional algorithm in an N-dimensional parameter space. In this document, we describe the algorithm and the details of our implementation and API. Exploiting the parallelism of the ensemble method, emcee permits any user to take advantage of multiple CPU cores without extra effort. The code is available online at http://dan.iel.fm/emcee under the MIT License.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Publications of the Astronomical Society of the Pacific, 2013 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Alan: İstatistik ve Olasılık

Statistics and ProbabilityMathematics