PofoliaPofolia ile paylaşıldı

Cancer Research· 2017Q1

TIMER: Tümör İnvaziv İmmün Hücrelerinin Kapsamlı Analizi İçin Bir Web Sunucusu

TIMER: A Web Server for Comprehensive Analysis of Tumor-Infiltrating Immune Cells

Taiwen Li, Jing‐Yu Fan, Binbin Wang, Nicole Traugh ve diğerleri

Kısa özet

TIMER adlı yeni bir web sunucusu, 32 kanser türündeki 10.897 tümör için önceden hesaplanmış immün hücre infiltrasyon seviyeleri sunarak tümör-immün etkileşimlerinin interaktif keşfini sağlıyor.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • TIMER, 32 kanser türündeki 10.897 tümör için önceden hesaplanmış immün hücre infiltrasyon seviyeleri sağlar.
  • Web sunucusu, tümör-immün etkileşimlerinin interaktif keşfi için altı analitik modül sunar.
  • Analizler, immün infiltratlar ile gen ekspresyonu, klinik sonuçlar, somatik mutasyonlar ve kopya sayısı değişiklikleri arasındaki ilişkiler üzerinde yapılabilir.
  • TIMER, dinamik analiz ve görselleştirme için kullanıcı dostu bir arayüze sahiptir.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

Abstract Recent clinical successes of cancer immunotherapy necessitate the investigation of the interaction between malignant cells and the host immune system. However, elucidation of complex tumor–immune interactions presents major computational and experimental challenges. Here, we present Tumor Immune Estimation Resource (TIMER; cistrome.shinyapps.io/timer) to comprehensively investigate molecular characterization of tumor–immune interactions. Levels of six tumor-infiltrating immune subsets are precalculated for 10,897 tumors from 32 cancer types. TIMER provides 6 major analytic modules that allow users to interactively explore the associations between immune infiltrates and a wide spectrum of factors, including gene expression, clinical outcomes, somatic mutations, and somatic copy number alterations. TIMER provides a user-friendly web interface for dynamic analysis and visualization of these associations, which will be of broad utilities to cancer researchers. Cancer Res; 77(21); e108–10. ©2017 AACR.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Cancer Research, 2017 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Alan: Onkoloji

OncologyMedicine