Journal of the American Society of Nephrology· 2018Q1
İnsan Böbrek Allogreft Biyopsi Örneğinin Tek Hücre Transkriptomik Analizi Çeşitli Bir İnflamatuar Yanıtı Tanımlıyor
Single-Cell Transcriptomics of a Human Kidney Allograft Biopsy Specimen Defines a Diverse Inflammatory Response
- 420atıf
- Q1SCImago
- 2018yıl
Kısa özet
Bu çalışma, insan böbrek nakli biyopsisine tek hücreli RNA dizilemesi uygulayarak 16 farklı hücre tipi ortaya koymakta ve reddiyette yeni segment-spesifik inflamatuar yanıtlar tanımlamaktadır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Tek hücreli RNA dizilemesi, bağışıklık ve yerel böbrek hücreleri dahil olmak üzere bir böbrek nakli biyopsisinde 16 farklı hücre tipini tanımlamıştır.
- CD16+ ifade eden bir grup ve dendritik hücre olgunlaşma belirteçleri ifade eden CD16- bir grup olmak üzere iki farklı monosit alt kümesi tanımlanmıştır.
- Reddetme sırasında böbrek epitel hücrelerinde yeni segmentlere özgü pro-inflamatuar yanıtlar gözlemlenmiştir.
- Fc reseptör yolu genlerini ifade eden bazı aktive olmuş endotel hücreleri, antikor aracılı reddetme patolojisiyle uyumlu olarak tanımlanmıştır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Background Single-cell genomics techniques are revolutionizing our ability to characterize complex tissues. By contrast, the techniques used to analyze renal biopsy specimens have changed little over several decades. We tested the hypothesis that single-cell RNA-sequencing can comprehensively describe cell types and states in a human kidney biopsy specimen. Methods We generated 8746 single-cell transcriptomes from a healthy adult kidney and a single kidney transplant biopsy core by single-cell RNA-sequencing. Unsupervised clustering analysis of the biopsy specimen was performed to identify 16 distinct cell types, including all of the major immune cell types and most native kidney cell types, in this biopsy specimen, for which the histologic read was mixed rejection. Results Monocytes formed two subclusters representing a nonclassical CD16+ group and a classic CD16− group expressing dendritic cell maturation markers. The presence of both monocyte cell subtypes was validated by staining of independent transplant biopsy specimens. Comparison of healthy kidney epithelial transcriptomes with biopsy specimen counterparts identified novel segment-specific proinflammatory responses in rejection. Endothelial cells formed three distinct subclusters: resting cells and two activated endothelial cell groups. One activated endothelial cell group expressed Fc receptor pathway activation and Ig internalization genes, consistent with the pathologic diagnosis of antibody-mediated rejection. We mapped previously defined genes that associate with rejection outcomes to single cell types and generated a searchable online gene expression database. Conclusions We present the first step toward incorporation of single-cell transcriptomics into kidney biopsy specimen interpretation, describe a heterogeneous immune response in mixed rejection, and provide a searchable resource for the scientific community.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Journal of the American Society of Nephrology, 2018 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Transplantasyon (Organ Nakli)
TransplantationMedicine