PofoliaPofolia ile paylaşıldı

Nucleic Acids Research· 2026Q1

SAbDab2: Makine Öğrenmesi Çağı İçin Yeniden Tasarlanan Yapısal Antikor Veritabanı

SAbDab2: the structural antibody database in the age of machine learning

Henriette Capel, Odysseas Vavourakis, Ben H. Williams, Christopher R. Taylor ve diğerleri

Kısa özet

SAbDab2, makine öğrenmesi (ML) çağı için tasarlanmış, çeşitli antikor formatlarını destekleyen ve antikor ile antikor-antijen kompleksleri için standartlaştırılmış, sürümlü ML düzeyinde yapısal veriler sunan yeni yeniden tasarlanmış bir yapısal antikor veritabanıdır.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • SAbDab2, makine öğrenmesi uygulamalarına yönelik olarak uyarlanmış, yeniden tasarlanmış bir yapısal antikor veritabanıdır.
  • Tekil antikor formatlarının ötesinde daha geniş bir yenilikçi antikor formatı yelpazesini desteklemektedir.
  • Veritabanı, antikor ve antikor-antijen kompleks yapılarının standartlaştırılmış, sürümlü eğitim/test kümelerini sunmaktadır.
  • SAbDab2 haftalık olarak güncellenmekte, ML düzeyindeki veri kümeleri ise altı ayda bir yenilenmektedir.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

The Structural Antibody Database (SAbDab) is a publicly available repository of experimentally determined antibody structures, first released in 2013. Explicit support for single-domain antibodies was added in 2021, with SAbDab-nano. Recently, increasing interest in antibodies has led to a proliferation of novel antibody formats, while simultaneous advances in machine learning (ML) have increased demand for standardized, high-quality structure data. Here, we present SAbDab2, re-engineered for the ML age. It introduces support for a variety of new formats, and makes it easy to retrieve and compare all known structures of a given antibody. In addition, SAbDab2 provides ready access to ML-grade structures of antibody and antibody-antigen-complexes, with standardized, versioned train/test splits. These will be updated every 6 months going forward and are available at https://zenodo.org/records/20083994. SAbDab2 itself is updated weekly and freely available at https://sabdab2.opig.stats.ox.ac.uk.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nucleic Acids Research, 2026 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Alan: Radyoloji, Nükleer Tıp ve Görüntüleme

Radiology, Nuclear Medicine and ImagingMedicine