Journal of Chemical Information and Modeling· 2021Q1
AutoDock Vina 1.2.0: Yeni Yerleştirme Yöntemleri, Genişletilmiş Kuvvet Alanı ve Python Bağlantıları
AutoDock Vina 1.2.0: New Docking Methods, Expanded Force Field, and Python Bindings
- 6.839atıf
- Q1SCImago
- 2021yıl
Kısa özet
AutoDock Vina 1.2.0 artık makrosiklus ve açık su molekülü modellemesini destekleyerek, diğer AutoDock programlarına kıyasla önceki bir sınırlamayı gidermiştir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- AutoDock Vina 1.2.0 artık makrosiklusları ve açık su moleküllerini modeller.
- AutoDock4.2 puanlama fonksiyonunu destekler.
- Birden fazla ligandın eşzamanlı yerleştirilmesini ve toplu işlemeyi etkinleştirir.
- Betikleme ve iş akışı otomasyonu için Python bağlantıları içerir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
AutoDock Vina is arguably one of the fastest and most widely used open-source programs for molecular docking. However, compared to other programs in the AutoDock Suite, it lacks support for modeling specific features such as macrocycles or explicit water molecules. Here, we describe the implementation of this functionality in AutoDock Vina 1.2.0. Additionally, AutoDock Vina 1.2.0 supports the AutoDock4.2 scoring function, simultaneous docking of multiple ligands, and a batch mode for docking a large number of ligands. Furthermore, we implemented Python bindings to facilitate scripting and the development of docking workflows. This work is an effort toward the unification of the features of the AutoDock4 and AutoDock Vina programs. The source code is available at https://github.com/ccsb-scripps/AutoDock-Vina.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Journal of Chemical Information and Modeling, 2021 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Hesaplamalı Kuram ve Matematik
Computational Theory and MathematicsComputer Science