Bioinformatics· 2016Q1
SweepFinder2: artırılmış hassasiyet, sağlamlık ve esneklik
S<scp>weep</scp>F<scp>inder</scp>2: increased sensitivity, robustness and flexibility
- 381atıf
- Q1SCImago
- 2016yıl
Kısa özet
SweepFinder yazılımının yeni bir sürümü olan SweepFinder2, mutasyon oranı değişkenliği ve arka plan seçiliminin etkilerini hesaba katarak yakın zamanda meydana gelen pozitif seçilimi tespit etmede artırılmış hassasiyet ve sağlamlık sunar.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- SweepFinder2, yakın zamanda meydana gelen pozitif seçilimi tespit etmede hassasiyeti ve sağlamlığı artırır.
- Daha önce sonuçları karıştıran mutasyon oranı değişkenliği ve arka plan seçilimini hesaba katar.
- Kullanıcılar artık test alanlarını belirleyebilir, aralarındaki mesafeleri ayarlayabilir ve daha fazla esneklik için rekombinasyon haritalarından yararlanabilir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
UNLABELLED: SweepFinder is a widely used program that implements a powerful likelihood-based method for detecting recent positive selection, or selective sweeps. Here, we present SweepFinder2, an extension of SweepFinder with increased sensitivity and robustness to the confounding effects of mutation rate variation and background selection. Moreover, SweepFinder2 has increased flexibility that enables the user to specify test sites, set the distance between test sites and utilize a recombination map. AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: SweepFinder2 is a freely-available (www.personal.psu.edu/mxd60/sf2.html) software package that is written in C and can be run from a Unix command line. CONTACT: mxd60@psu.edu.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Bioinformatics, 2016 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Yazılım
SoftwareComputer Science