Current Protocols in Bioinformatics· 2016
MODELLER Kullanarak Karşılaştırmalı Protein Yapı Modellemesi
Comparative Protein Structure Modeling Using MODELLER
- 4.522atıf
- 2016yıl
Kısa özet
MODELLER yazılımı, hedef protein dizisini bilinen yapılarla (şablonlar) hizalayarak 3B formunu tahmin eden karşılaştırmalı protein yapı modellemesini sağlar.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Karşılaştırmalı protein yapı modellemesi, bilinen yapıları şablon olarak kullanarak dizilerden 3B protein yapılarını tahmin eder.
- Süreç, katlanma ataması, hedef-şablon hizalaması, model oluşturma ve değerlendirmeyi içerir.
- MODELLER yazılımı ve ModBase veritabanı, bu karşılaştırmalı modelleri hesaplamak ve bunlara erişmek için kullanılır.
- Trichomonas vaginalis'ten laktat dehidrojenaz bir vaka çalışması olarak sunulmaktadır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Abstract Comparative protein structure modeling predicts the three‐dimensional structure of a given protein sequence (target) based primarily on its alignment to one or more proteins of known structure (templates). The prediction process consists of fold assignment, target‐template alignment, model building, and model evaluation. This unit describes how to calculate comparative models using the program MODELLER and how to use the ModBase database of such models, and discusses all four steps of comparative modeling, frequently observed errors, and some applications. Modeling lactate dehydrogenase from Trichomonas vaginalis (TvLDH) is described as an example. The download and installation of the MODELLER software is also described. © 2016 by John Wiley & Sons, Inc.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Current Protocols in Bioinformatics, 2016 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Malzeme Kimyası
Materials ChemistryMaterials Science