Science· 2016Q1
Tek hücreli RNA-seq, metastatik melanomun çok hücreli ekosistemini ortaya koyuyor
Dissecting the multicellular ecosystem of metastatic melanoma by single-cell RNA-seq
- 5.325atıf
- Q1SCImago
- 2016yıl
Kısa özet
19 hastadan alınan 4645 melanom hücresinin tek hücreli RNA dizilemesi, ilaç direncine bağlı farklılaşmış haller (örn. yüksek MITF'e karşılık düşük MITF/yüksek AXL) dahil olmak üzere malign hücrelerde transkripsiyonel heterojenliği belirledi. Analiz ayrıca tümör mikroçevresel örüntüleri ve T hücresi yorgunluk programlarını da haritalandırdı.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Tek hücreli RNA-seq, 19 metastatik melanom tümöründen 4645 hücreyi profilledi.
- Malign hücreler, değişken MITF ve AXL seviyeleri ile ilişkili farklılaşmış haller dahil olmak üzere transkripsiyonel heterojenlik gösterdi.
- Tümör mikroçevresel örüntüleri ve hücreler arası etkileşimler analiz edildi.
- Tümörlere sızan T hücreleri, aktivasyon ve klonal genişleme ile bağlantılı yorgunluk programları sergiledi.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
To explore the distinct genotypic and phenotypic states of melanoma tumors, we applied single-cell RNA sequencing (RNA-seq) to 4645 single cells isolated from 19 patients, profiling malignant, immune, stromal, and endothelial cells. Malignant cells within the same tumor displayed transcriptional heterogeneity associated with the cell cycle, spatial context, and a drug-resistance program. In particular, all tumors harbored malignant cells from two distinct transcriptional cell states, such that tumors characterized by high levels of the MITF transcription factor also contained cells with low MITF and elevated levels of the AXL kinase. Single-cell analyses suggested distinct tumor microenvironmental patterns, including cell-to-cell interactions. Analysis of tumor-infiltrating T cells revealed exhaustion programs, their connection to T cell activation and clonal expansion, and their variability across patients. Overall, we begin to unravel the cellular ecosystem of tumors and how single-cell genomics offers insights with implications for both targeted and immune therapies.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Science, 2016 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Onkoloji
OncologyMedicine