Nature Structural & Molecular Biology· 2026Q1
İnsan hücre hatlarının bir fosfoproteom atlası kinaz aktivitesi manzarasını ortaya koyuyor
A phosphoproteome atlas of human cell lines reveals the landscape of kinase activity
- 1atıf
- Q1SCImago
- 2026yıl
Kısa özet
33 insan hücre hattından oluşan yeni bir fosfoproteom atlası, 200.000'den fazla fosfositi içermekte olup, fosfoproteomik veri işleme hızını (30 kat daha hızlı) ve fosfosit tanımlama güvenilirliğini, düşük örnek girdisiyle bile önemli ölçüde iyileştirir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Yeni kaynak, 33 farklı insan hücre hattından elde edilen 200.000'den fazla sınıf I fosfositi içermektedir.
- Spektral kütüphane, tek atışlı fosfoproteomikleri iyileştirerek, kütüphanesiz yöntemlere göre 30 kat daha hızlı veri işleme sağlar.
- Özellikle düşük örnek girdisiyle fosfosit lokalizasyon güvenilirliğini artırır.
- Hücreye özgü sinyal verme zayıflıklarını ve ilaç duyarlılığı korelasyonlarını ortaya koyan birleşik bir kinaz aktivite skoru (Cscore) geliştirildi.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Abstract Protein phosphorylation orchestrates cellular signaling and controls most biological processes, with its dysregulation driving diseases, notably cancer. Comprehensive, high-throughput phosphoproteomics remains limited by detection sensitivity, data completeness and computational bottlenecks, especially in low-input settings. Here we present a comprehensive empirical human phosphoproteome resource, regrouping over 200,000 class I phosphosites across 33 diverse human cell lines. We demonstrate that this spectral library dramatically improves single-shot phosphoproteomics with 30-fold faster data processing compared with library-free approaches and enhances confidence in phosphosite localization even from minimal sample input. Integrating proteome and phosphoproteome data, we develop a combined kinase activity score (Cscore), revealing cell line- and cancer-specific signaling vulnerabilities, many correlating with drug sensitivity. This resource accelerates deep and reproducible phosphoproteomics, enables the systematic mapping of cellular signaling networks and may empower precision oncology by highlighting actionable kinase targets in diverse cell states.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nature Structural & Molecular Biology, 2026 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Spektroskopi
SpectroscopyChemistry