Nucleic Acids Research· 2023Q1
antiSMASH 7.0: Mikroorganizma Bileşiklerinin Tespit, Regülasyon ve Görselleştirilmesinde Geliştirmeler
antiSMASH 7.0: new and improved predictions for detection, regulation, chemical structures and visualisation
- 2.273atıf
- Q1SCImago
- 2023yıl
Kısa özet
antiSMASH 7.0, desteklenen biyosentetik gen kümesi (BGC) türlerini 71'den 81'e çıkararak, kimyasal yapı tahminini iyileştirerek ve enzimatik montaj hattı ile gen kümesi regülasyonunun görselleştirilmesini geliştirerek mikrobiyal genom madenciliğini önemli ölçüde iyileştirir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- antiSMASH 7.0 artık 71'den 81'e çıkarak 81 tür biyosentetik gen kümesini (BGC) desteklemektedir.
- Güncelleme, ikincil metabolitlerin kimyasal yapılarının tahmin edilmesi için geliştirilmiş algoritmalar içermektedir.
- Yeni özellikler, enzimatik montaj hattı yollarının görselleştirilmesini iyileştirmektedir.
- Bu sürümde gen kümesi regülasyonu tahmini de iyileştirilmiştir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Microorganisms produce small bioactive compounds as part of their secondary or specialised metabolism. Often, such metabolites have antimicrobial, anticancer, antifungal, antiviral or other bio-activities and thus play an important role for applications in medicine and agriculture. In the past decade, genome mining has become a widely-used method to explore, access, and analyse the available biodiversity of these compounds. Since 2011, the 'antibiotics and secondary metabolite analysis shell-antiSMASH' (https://antismash.secondarymetabolites.org/) has supported researchers in their microbial genome mining tasks, both as a free to use web server and as a standalone tool under an OSI-approved open source licence. It is currently the most widely used tool for detecting and characterising biosynthetic gene clusters (BGCs) in archaea, bacteria, and fungi. Here, we present the updated version 7 of antiSMASH. antiSMASH 7 increases the number of supported cluster types from 71 to 81, as well as containing improvements in the areas of chemical structure prediction, enzymatic assembly-line visualisation and gene cluster regulation.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nucleic Acids Research, 2023 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Hesaplamalı Kuram ve Matematik
Computational Theory and MathematicsComputer Science