PofoliaPofolia ile paylaşıldı

Nucleic Acids Research· 2020Q1

InterPro protein aileleri ve alanları veritabanı: 20 yıl sonra

The InterPro protein families and domains database: 20 years on

Matthias Blum, Hsin-Yu Chang, Sara Chuguransky, Tiago Grego ve diğerleri

Kısa özet

Protein sınıflandırması için kapsamlı bir kaynak olan InterPro veritabanı, içeriğinde ve ilgili yazılımlarında önemli güncellemelerle 20. faaliyet yılına ulaşmıştır.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • InterPro, protein dizilerinin, ailelerinin ve alanlarının entegre bir sınıflandırmasını sağlar.
  • InterProScan, dizileri InterPro'nun tahmin modellerine (imzalar) karşı aramak için kullanılan yazılımdır.
  • Veritabanı, yeni içerik ve özelliklerle 81.0 sürümüne güncellenmiştir.
  • Yeni geliştirmeler arasında yeniden tasarlanmış bir web sitesi ve programatik erişim için bir REST API bulunmaktadır.
  • InterProScan yazılımı için performans iyileştirmeleri yapılmıştır.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

The InterPro database (https://www.ebi.ac.uk/interpro/) provides an integrative classification of protein sequences into families, and identifies functionally important domains and conserved sites. InterProScan is the underlying software that allows protein and nucleic acid sequences to be searched against InterPro's signatures. Signatures are predictive models which describe protein families, domains or sites, and are provided by multiple databases. InterPro combines signatures representing equivalent families, domains or sites, and provides additional information such as descriptions, literature references and Gene Ontology (GO) terms, to produce a comprehensive resource for protein classification. Founded in 1999, InterPro has become one of the most widely used resources for protein family annotation. Here, we report the status of InterPro (version 81.0) in its 20th year of operation, and its associated software, including updates to database content, the release of a new website and REST API, and performance improvements in InterProScan.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nucleic Acids Research, 2020 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Alan: Spektroskopi

SpectroscopyChemistry