Nucleic Acids Research· 2015Q1
PRIDE veritabanı ve ilgili araçlarının 2016 güncellemesi
2016 update of the PRIDE database and its related tools
- 3.668atıf
- Q1SCImago
- 2015yıl
Kısa özet
Kütle spektrometrisi proteomik verileri için önde gelen bir depo olan PRIDE Archive, yeni bir depolama arka ucu, gönderim sistemi ve web arayüzü ile yeniden geliştirildi, önemli veri standartlarını destekliyor ve veri gönderimlerinde önemli bir artış görüyor.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- PRIDE Archive, orijinal PRIDE veritabanının yerini alan yeni arşivleme sistemidir.
- Yeniden geliştirme, yeni bir depolama arka ucu, veri gönderim sistemi ve web arayüzünü içermektedir.
- PSI veri standardı formatlarını (mzML, mzIdentML) ve ProteomeXchange Konsorsiyumu yönergelerini destekler.
- Veri gönderimleri ayda yaklaşık 150 veri setine yükselmiştir.
- PRIDE Inspector ve PRIDE Converter 2 gibi ilgili araçlar hakkında güncellemeler sunulmakta ve PRIDE Cluster ve PRIDE Proteomes gibi yeni kaynaklar geliştirme aşamasındadır.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
The PRoteomics IDEntifications (PRIDE) database is one of the world-leading data repositories of mass spectrometry (MS)-based proteomics data. Since the beginning of 2014, PRIDE Archive (http://www.ebi.ac.uk/pride/archive/) is the new PRIDE archival system, replacing the original PRIDE database. Here we summarize the developments in PRIDE resources and related tools since the previous update manuscript in the Database Issue in 2013. PRIDE Archive constitutes a complete redevelopment of the original PRIDE, comprising a new storage backend, data submission system and web interface, among other components. PRIDE Archive supports the most-widely used PSI (Proteomics Standards Initiative) data standard formats (mzML and mzIdentML) and implements the data requirements and guidelines of the ProteomeXchange Consortium. The wide adoption of ProteomeXchange within the community has triggered an unprecedented increase in the number of submitted data sets (around 150 data sets per month). We outline some statistics on the current PRIDE Archive data contents. We also report on the status of the PRIDE related stand-alone tools: PRIDE Inspector, PRIDE Converter 2 and the ProteomeXchange submission tool. Finally, we will give a brief update on the resources under development 'PRIDE Cluster' and 'PRIDE Proteomes', which provide a complementary view and quality-scored information of the peptide and protein identification data available in PRIDE Archive.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nucleic Acids Research, 2015 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Spektroskopi
SpectroscopyChemistry