PofoliaPofolia ile paylaşıldı

Nucleic Acids Research· 2012Q1

Proteomik Tanımlamaları (PRIDE) veritabanı ve ilgili araçlar: 2013 durumu

The Proteomics Identifications (PRIDE) database and associated tools: status in 2013

Juan Antonio Vizcaíno, Richard G. Côté, Attila Csordás, José A. Dianes ve diğerleri

Kısa özet

Kütle spektrometrisi tabanlı proteomik verileri için önde gelen bir depo olan PRIDE veritabanı, içeriğine ilişkin yeni istatistikler ve gönderim ile analiz araçlarının açıklamalarıyla güncellenmiştir.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • 2013 yılı için PRIDE veritabanı istatistikleri, organizma ve türe göre veri içeriği dahil güncellenmiştir.
  • Yeni gönderim aracı PRIDE Converter 2 ve analiz aracı PRIDE Inspector artık mevcuttur.
  • PRIDE, ProteomeXchange konsorsiyumu aracılığıyla diğer MS proteomik kaynaklarıyla entegre olmaktadır.
  • Devam eden kalite kontrol çabaları ve veritabanı için gelecek planları özetlenmektedir.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

The PRoteomics IDEntifications (PRIDE, http://www.ebi.ac.uk/pride) database at the European Bioinformatics Institute is one of the most prominent data repositories of mass spectrometry (MS)-based proteomics data. Here, we summarize recent developments in the PRIDE database and related tools. First, we provide up-to-date statistics in data content, splitting the figures by groups of organisms and species, including peptide and protein identifications, and post-translational modifications. We then describe the tools that are part of the PRIDE submission pipeline, especially the recently developed PRIDE Converter 2 (new submission tool) and PRIDE Inspector (visualization and analysis tool). We also give an update about the integration of PRIDE with other MS proteomics resources in the context of the ProteomeXchange consortium. Finally, we briefly review the quality control efforts that are ongoing at present and outline our future plans.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nucleic Acids Research, 2012 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Google Play'den indir App Store'dan indir

Benzer makaleler

Alan: Spektroskopi

SpectroscopyChemistry