Bioinformatics· 2013Q1
Protter: İnteraktif Protein Özellikleri Görselleştirmesi ve Deneysel Proteomik Veri Entegrasyonu
Protter: interactive protein feature visualization and integration with experimental proteomic data
- 1.429atıf
- Q1SCImago
- 2013yıl
Kısa özet
Protter, protein topolojisi bağlamında açıklanmış protein dizisi özelliklerini ve deneysel proteomik verileri görselleştiren yeni bir web tabanlı araçtır, bu da interaktif veri analizi ve hipotez üretimini mümkün kılar.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Protter, açıklanmış dizi özelliklerini ve deneysel proteomik verileri protein topolojisi bağlamında görselleştirir.
- Araç, çok sayıda proteomik dosya formatını destekler ve birden fazla referans protein açıklama kaynağını entegre eder.
- Proteomik araştırmacıları için interaktif veri analizi ve hipotez üretimini sağlar.
- Protter, büyük veri kümeleri için bile yayın kalitesinde özelleştirilmiş protein çizimleri üretebilir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
SUMMARY: The ability to integrate and visualize experimental proteomic evidence in the context of rich protein feature annotations represents an unmet need of the proteomics community. Here we present Protter, a web-based tool that supports interactive protein data analysis and hypothesis generation by visualizing both annotated sequence features and experimental proteomic data in the context of protein topology. Protter supports numerous proteomic file formats and automatically integrates a variety of reference protein annotation sources, which can be readily extended via modular plug-ins. A built-in export function produces publication-quality customized protein illustrations, also for large datasets. Visualizations of surfaceome datasets show the specific utility of Protter for the integrated visual analysis of membrane proteins and peptide selection for targeted proteomics. AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: The Protter web application is available at http://wlab.ethz.ch/protter. Source code and installation instructions are available at http://ulo.github.io/Protter/. CONTACT: wbernd@ethz.ch SUPPLEMENTARY INFORMATION: Supplementary data are available at Bioinformatics online.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Bioinformatics, 2013 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Spektroskopi
SpectroscopyChemistry