PofoliaPofolia ile paylaşıldı

Nucleic Acids Research· 2018Q1

iProX: entegre bir proteom kaynağı

iProX: an integrated proteome resource

Jie Ma, Tao Chen, Songfeng Wu, Chunyuan Yang ve diğerleri

Kısa özet

iProX, kütle spektrometrisi tabanlı deneylerden elde edilen ham proteom verilerinin, analiz sonuçlarının ve meta verilerin dünya çapında erişimini ve paylaşımını kolaylaştırmak için geliştirilmiş yeni bir kamu platformudur.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Ana noktalar

  • iProX, ham proteom verileri, analiz sonuçları ve meta verilerin paylaşımı için bir kamu platformudur.
  • Geniş kontrollü kelime dağarcıkları ve ontolojilerle kütle spektrometrisi tabanlı proteomik veri setlerini destekler.
  • Veri erişimi için web tabanlı bir gönderim süreci ve hızlı bir Aspera tabanlı transfer aracı sunar.
  • iProX, açık ve kararlı veri paylaşımını sağlayan ProteomeXchange konsorsiyumunun tam bir üyesidir.

Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.

Özet (abstract)

Sharing of research data in public repositories has become best practice in academia. With the accumulation of massive data, network bandwidth and storage requirements are rapidly increasing. The ProteomeXchange (PX) consortium implements a mode of centralized metadata and distributed raw data management, which promotes effective data sharing. To facilitate open access of proteome data worldwide, we have developed the integrated proteome resource iProX (http://www.iprox.org) as a public platform for collecting and sharing raw data, analysis results and metadata obtained from proteomics experiments. The iProX repository employs a web-based proteome data submission process and open sharing of mass spectrometry-based proteomics datasets. Also, it deploys extensive controlled vocabularies and ontologies to annotate proteomics datasets. Users can use a GUI to provide and access data through a fast Aspera-based transfer tool. iProX is a full member of the PX consortium; all released datasets are freely accessible to the public. iProX is based on a high availability architecture and has been deployed as part of the proteomics infrastructure of China, ensuring long-term and stable resource support. iProX will facilitate worldwide data analysis and sharing of proteomics experiments.

Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nucleic Acids Research, 2018 · DOI ↗

ÇıkarımlarPremium
Makaleye SorÜcretsiz hesapla

Ücretsiz hesapla devam et

Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.

Web'de ücretsiz devam et

Google ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.

Telefonda:

Alan: Spektroskopi

SpectroscopyChemistry