Bioinformatics· 2018Q1
Nextstrain: patojen evriminin gerçek zamanlı takibi
Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution
- 3.452atıf
- Q1SCImago
- 2018yıl
Kısa özet
Nextstrain, coğrafi ve serolojik bilgileri genomik verilerle birleştirerek viral patojen evrimini ve yayılımını izlemek için gerçek zamanlı, entegre bir platform sunar.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- Nextstrain, viral genom veritabanlarını, biyoinformatik boru hatlarını ve etkileşimli görselleştirmeleri entegre eder.
- Platform, patojen evriminin ve yayılımının gerçek zamanlı bir görünümünü sağlar.
- Sekans verilerini coğrafi, serolojik ve konak türü bilgileriyle birleştirir.
- Tüm kod GitHub'da mevcuttur ve web uygulaması çevrimiçi olarak erişilebilirdir.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
Summary: Understanding the spread and evolution of pathogens is important for effective public health measures and surveillance. Nextstrain consists of a database of viral genomes, a bioinformatics pipeline for phylodynamics analysis, and an interactive visualization platform. Together these present a real-time view into the evolution and spread of a range of viral pathogens of high public health importance. The visualization integrates sequence data with other data types such as geographic information, serology, or host species. Nextstrain compiles our current understanding into a single accessible location, open to health professionals, epidemiologists, virologists and the public alike. Availability and implementation: All code (predominantly JavaScript and Python) is freely available from github.com/nextstrain and the web-application is available at nextstrain.org.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Bioinformatics, 2018 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Halk Sağlığı, Çevre ve İş Sağlığı
Public Health, Environmental and Occupational HealthMedicine