Nucleic Acids Research· 2021Q1
iProX 2021'de: proteomik veri paylaşımını büyük veriyle bağlamak
iProX in 2021: connecting proteomics data sharing with big data
- 1.115atıf
- Q1SCImago
- 2021yıl
Kısa özet
Entegre proteom kaynağı iProX, 2021'de proteomik veri kümeleri için PB düzeyinde depolama ve saniye düzeyinde sorgu gecikmesi sağlayan bir büyük veri platformu başlattı.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Ana noktalar
- iProX, 2021'de ölçeklenebilir depolama için hiper-konverjan mimari ve Hadoop kümesi içeren bir büyük veri platformu uyguladı.
- Dağıtılmış bir Elastic Search motoru, saniyeden kısa sürede milyonlarca kaydın sorgulanmasını sağlar.
- Yeni özellikler arasında Evrensel Spektrum Tanımlayıcıları (USI) desteği, RESTful Web Servis API'si ve verimli bir yeniden analiz işlem hattı bulunmaktadır.
- Ağustos 2021 itibarıyla iProX, toplam 92,42 TB'lık 1526 veri kümesi içeriyordu ve PB düzeyinde depolama kapasitesine sahipti.
Yapay zekâ ile başlık ve abstract'tan üretildi; tam metin okunmaz.
Özet (abstract)
The rapid development of proteomics studies has resulted in large volumes of experimental data. The emergence of big data platform provides the opportunity to handle these large amounts of data. The integrated proteome resource, iProX (https://www.iprox.cn), which was initiated in 2017, has been greatly improved with an up-to-date big data platform implemented in 2021. Here, we describe the main iProX developments since its first publication in Nucleic Acids Research in 2019. First, a hyper-converged architecture with high scalability supports the submission process. A hadoop cluster can store large amounts of proteomics datasets, and a distributed, RESTful-styled Elastic Search engine can query millions of records within one second. Also, several new features, including the Universal Spectrum Identifier (USI) mechanism proposed by ProteomeXchange, RESTful Web Service API, and a high-efficiency reanalysis pipeline, have been added to iProX for better open data sharing. By the end of August 2021, 1526 datasets had been submitted to iProX, reaching a total data volume of 92.42TB. With the implementation of the big data platform, iProX can support PB-level data storage, hundreds of billions of spectra records, and second-level latency service capabilities that meet the requirements of the fast growing field of proteomics.
Yazarların özeti; kaynağından alınmıştır. Nucleic Acids Research, 2021 · DOI ↗
Ücretsiz hesapla devam et
Makaleye Sor ile bu makaleye günde 3 soru ücretsiz; makaleyi kaydet, kaynakçasını al, ilgi alanına göre her gün yeni özetler. Çıkarımlar Premium.
Web'de ücretsiz devam etGoogle ya da Apple hesabınla giriş; kart istemez. Bu makaleye geri dönersin.
Telefonda:
Alan: Spektroskopi
SpectroscopyChemistry